Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUH2

Lhx9, LIM/homeobox protein Lhx9, mousemouse

Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhx9Q9WUH2 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Lhx9Q9WUH2 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Lhx9Q9WUH2 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Lhx9Q9WUH2 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Lhx9Q9WUH2 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Lhx9Q9WUH2 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Lhx9Q9WUH2 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Lhx9Q9WUH2 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Lhx9Q9WUH2 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Lhx9Q9WUH2 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Lhx9Q9WUH2 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Lhx9Q9WUH2 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Lhx9Q9WUH2 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Lhx9Q9WUH2 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Lhx9Q9WUH2 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Lhx9Q9WUH2 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Lhx9Q9WUH2 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Lhx9Q9WUH2 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Lhx9Q9WUH2 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Lhx9Q9WUH2 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Lhx9Q9WUH2 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Lhx9Q9WUH2 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Lhx9Q9WUH2 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Lhx9Q9WUH2 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Lhx9Q9WUH2 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Lhx9Q9WUH2 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Lhx9Q9WUH2 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Lhx9Q9WUH2 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Lhx9Q9WUH2 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Lhx9Q9WUH2 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Lhx9Q9WUH2 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Lhx9Q9WUH2 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Lhx9Q9WUH2 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Lhx9Q9WUH2 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Lhx9Q9WUH2 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Lhx9Q9WUH2 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Lhx9Q9WUH2 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Lhx9Q9WUH2 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Lhx9Q9WUH2 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Lhx9Q9WUH2 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Lhx9Q9WUH2 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Lhx9Q9WUH2 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Lhx9Q9WUH2 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Lhx9Q9WUH2 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Lhx9Q9WUH2 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Lhx9Q9WUH2 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Lhx9Q9WUH2 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Lhx9Q9WUH2 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Lhx9Q9WUH2 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Lhx9Q9WUH2 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Lhx9Q9WUH2 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Lhx9Q9WUH2 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Lhx9Q9WUH2 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Lhx9Q9WUH2 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Lhx9Q9WUH2 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Lhx9Q9WUH2 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Lhx9Q9WUH2 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Lhx9Q9WUH2 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Lhx9Q9WUH2 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Lhx9Q9WUH2 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Lhx9Q9WUH2 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Lhx9Q9WUH2 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Lhx9Q9WUH2 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Lhx9Q9WUH2 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Lhx9Q9WUH2 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Lhx9Q9WUH2 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Lhx9Q9WUH2 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Lhx9Q9WUH2 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Lhx9Q9WUH2 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Lhx9Q9WUH2 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Lhx9Q9WUH2 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Lhx9Q9WUH2 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Lhx9Q9WUH2 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Lhx9Q9WUH2 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Lhx9Q9WUH2 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Lhx9Q9WUH2 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Lhx9Q9WUH2 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Lhx9Q9WUH2 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Lhx9Q9WUH2 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Lhx9Q9WUH2 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Lhx9Q9WUH2 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Lhx9Q9WUH2 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Lhx9Q9WUH2 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Lhx9Q9WUH2 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Lhx9Q9WUH2 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Lhx9Q9WUH2 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Lhx9Q9WUH2 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Lhx9Q9WUH2 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Lhx9Q9WUH2 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Lhx9Q9WUH2 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Lhx9Q9WUH2 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Lhx9Q9WUH2 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Lhx9Q9WUH2 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Lhx9Q9WUH2 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Lhx9Q9WUH2 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Lhx9Q9WUH2 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Lhx9Q9WUH2 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Lhx9Q9WUH2 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Lhx9Q9WUH2 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Lhx9Q9WUH2 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms