Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU22

Ptpn4, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 4, mousemouse

Predictions only

Length 926 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn4Q9WU22 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ptpn4Q9WU22 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ptpn4Q9WU22 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ptpn4Q9WU22 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ptpn4Q9WU22 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ptpn4Q9WU22 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ptpn4Q9WU22 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ptpn4Q9WU22 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ptpn4Q9WU22 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ptpn4Q9WU22 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ptpn4Q9WU22 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ptpn4Q9WU22 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ptpn4Q9WU22 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ptpn4Q9WU22 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ptpn4Q9WU22 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ptpn4Q9WU22 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ptpn4Q9WU22 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ptpn4Q9WU22 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ptpn4Q9WU22 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ptpn4Q9WU22 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ptpn4Q9WU22 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ptpn4Q9WU22 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ptpn4Q9WU22 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ptpn4Q9WU22 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ptpn4Q9WU22 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ptpn4Q9WU22 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ptpn4Q9WU22 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Ptpn4Q9WU22 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ptpn4Q9WU22 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ptpn4Q9WU22 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ptpn4Q9WU22 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ptpn4Q9WU22 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ptpn4Q9WU22 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ptpn4Q9WU22 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ptpn4Q9WU22 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ptpn4Q9WU22 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ptpn4Q9WU22 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Ptpn4Q9WU22 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ptpn4Q9WU22 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ptpn4Q9WU22 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ptpn4Q9WU22 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ptpn4Q9WU22 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ptpn4Q9WU22 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ptpn4Q9WU22 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ptpn4Q9WU22 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ptpn4Q9WU22 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ptpn4Q9WU22 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ptpn4Q9WU22 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ptpn4Q9WU22 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ptpn4Q9WU22 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ptpn4Q9WU22 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ptpn4Q9WU22 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ptpn4Q9WU22 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ptpn4Q9WU22 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ptpn4Q9WU22 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ptpn4Q9WU22 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ptpn4Q9WU22 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ptpn4Q9WU22 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ptpn4Q9WU22 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ptpn4Q9WU22 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ptpn4Q9WU22 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ptpn4Q9WU22 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ptpn4Q9WU22 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ptpn4Q9WU22 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ptpn4Q9WU22 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ptpn4Q9WU22 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Ptpn4Q9WU22 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ptpn4Q9WU22 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ptpn4Q9WU22 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ptpn4Q9WU22 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ptpn4Q9WU22 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ptpn4Q9WU22 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ptpn4Q9WU22 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Ptpn4Q9WU22 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ptpn4Q9WU22 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ptpn4Q9WU22 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ptpn4Q9WU22 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ptpn4Q9WU22 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ptpn4Q9WU22 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ptpn4Q9WU22 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ptpn4Q9WU22 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ptpn4Q9WU22 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ptpn4Q9WU22 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ptpn4Q9WU22 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ptpn4Q9WU22 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ptpn4Q9WU22 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ptpn4Q9WU22 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ptpn4Q9WU22 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ptpn4Q9WU22 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ptpn4Q9WU22 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Ptpn4Q9WU22 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ptpn4Q9WU22 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ptpn4Q9WU22 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ptpn4Q9WU22 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ptpn4Q9WU22 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ptpn4Q9WU22 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ptpn4Q9WU22 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ptpn4Q9WU22 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Ptpn4Q9WU22 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ptpn4Q9WU22 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms