Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTP9

Vax2, Ventral anterior homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vax2Q9WTP9 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Vax2Q9WTP9 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Vax2Q9WTP9 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Vax2Q9WTP9 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Vax2Q9WTP9 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Vax2Q9WTP9 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Vax2Q9WTP9 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Vax2Q9WTP9 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Vax2Q9WTP9 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Vax2Q9WTP9 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Vax2Q9WTP9 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Vax2Q9WTP9 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Vax2Q9WTP9 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Vax2Q9WTP9 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Vax2Q9WTP9 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Vax2Q9WTP9 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Vax2Q9WTP9 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Vax2Q9WTP9 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Vax2Q9WTP9 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Vax2Q9WTP9 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Vax2Q9WTP9 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Vax2Q9WTP9 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Vax2Q9WTP9 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Vax2Q9WTP9 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Vax2Q9WTP9 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Vax2Q9WTP9 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Vax2Q9WTP9 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Vax2Q9WTP9 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Vax2Q9WTP9 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Vax2Q9WTP9 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Vax2Q9WTP9 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Vax2Q9WTP9 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Vax2Q9WTP9 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Vax2Q9WTP9 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Vax2Q9WTP9 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Vax2Q9WTP9 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Vax2Q9WTP9 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Vax2Q9WTP9 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Vax2Q9WTP9 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Vax2Q9WTP9 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Vax2Q9WTP9 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Vax2Q9WTP9 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Vax2Q9WTP9 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Vax2Q9WTP9 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Vax2Q9WTP9 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Vax2Q9WTP9 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Vax2Q9WTP9 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Vax2Q9WTP9 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Vax2Q9WTP9 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Vax2Q9WTP9 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Vax2Q9WTP9 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Vax2Q9WTP9 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
Vax2Q9WTP9 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Vax2Q9WTP9 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Vax2Q9WTP9 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Vax2Q9WTP9 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Vax2Q9WTP9 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Vax2Q9WTP9 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Vax2Q9WTP9 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Vax2Q9WTP9 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Vax2Q9WTP9 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Vax2Q9WTP9 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Vax2Q9WTP9 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Vax2Q9WTP9 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Vax2Q9WTP9 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Vax2Q9WTP9 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
Vax2Q9WTP9 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Vax2Q9WTP9 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vax2Q9WTP9 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vax2Q9WTP9 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vax2Q9WTP9 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vax2Q9WTP9 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vax2Q9WTP9 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vax2Q9WTP9 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vax2Q9WTP9 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vax2Q9WTP9 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vax2Q9WTP9 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vax2Q9WTP9 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vax2Q9WTP9 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vax2Q9WTP9 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Vax2Q9WTP9 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Vax2Q9WTP9 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vax2Q9WTP9 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vax2Q9WTP9 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vax2Q9WTP9 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Vax2Q9WTP9 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Vax2Q9WTP9 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Vax2Q9WTP9 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Vax2Q9WTP9 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Vax2Q9WTP9 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Vax2Q9WTP9 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Vax2Q9WTP9 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Vax2Q9WTP9 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Vax2Q9WTP9 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Vax2Q9WTP9 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Vax2Q9WTP9 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Vax2Q9WTP9 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Vax2Q9WTP9 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Vax2Q9WTP9 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Vax2Q9WTP9 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms