Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1P3

Psmb2, Proteasome subunit beta type-2, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb2Q9R1P3 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Psmb2Q9R1P3 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Psmb2Q9R1P3 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Psmb2Q9R1P3 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Psmb2Q9R1P3 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Psmb2Q9R1P3 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Psmb2Q9R1P3 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Psmb2Q9R1P3 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Psmb2Q9R1P3 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Psmb2Q9R1P3 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Psmb2Q9R1P3 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Psmb2Q9R1P3 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Psmb2Q9R1P3 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Psmb2Q9R1P3 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Psmb2Q9R1P3 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Psmb2Q9R1P3 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Psmb2Q9R1P3 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Psmb2Q9R1P3 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Psmb2Q9R1P3 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Psmb2Q9R1P3 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Psmb2Q9R1P3 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Psmb2Q9R1P3 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Psmb2Q9R1P3 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Psmb2Q9R1P3 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Psmb2Q9R1P3 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Psmb2Q9R1P3 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Psmb2Q9R1P3 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Psmb2Q9R1P3 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Psmb2Q9R1P3 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Psmb2Q9R1P3 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Psmb2Q9R1P3 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Psmb2Q9R1P3 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Psmb2Q9R1P3 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Psmb2Q9R1P3 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Psmb2Q9R1P3 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Psmb2Q9R1P3 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Psmb2Q9R1P3 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Psmb2Q9R1P3 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Psmb2Q9R1P3 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Psmb2Q9R1P3 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Psmb2Q9R1P3 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Psmb2Q9R1P3 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Psmb2Q9R1P3 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Psmb2Q9R1P3 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Psmb2Q9R1P3 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Psmb2Q9R1P3 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Psmb2Q9R1P3 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Psmb2Q9R1P3 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Psmb2Q9R1P3 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Psmb2Q9R1P3 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Psmb2Q9R1P3 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Psmb2Q9R1P3 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Psmb2Q9R1P3 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Psmb2Q9R1P3 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Psmb2Q9R1P3 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Psmb2Q9R1P3 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Psmb2Q9R1P3 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Psmb2Q9R1P3 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Psmb2Q9R1P3 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Psmb2Q9R1P3 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Psmb2Q9R1P3 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Psmb2Q9R1P3 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Psmb2Q9R1P3 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Psmb2Q9R1P3 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Psmb2Q9R1P3 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Psmb2Q9R1P3 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Psmb2Q9R1P3 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Psmb2Q9R1P3 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Psmb2Q9R1P3 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Psmb2Q9R1P3 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Psmb2Q9R1P3 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Psmb2Q9R1P3 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Psmb2Q9R1P3 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Psmb2Q9R1P3 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Psmb2Q9R1P3 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Psmb2Q9R1P3 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Psmb2Q9R1P3 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Psmb2Q9R1P3 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Psmb2Q9R1P3 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Psmb2Q9R1P3 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Psmb2Q9R1P3 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Psmb2Q9R1P3 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Psmb2Q9R1P3 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Psmb2Q9R1P3 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Psmb2Q9R1P3 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Psmb2Q9R1P3 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Psmb2Q9R1P3 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Psmb2Q9R1P3 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Psmb2Q9R1P3 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Psmb2Q9R1P3 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Psmb2Q9R1P3 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Psmb2Q9R1P3 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Psmb2Q9R1P3 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Psmb2Q9R1P3 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Psmb2Q9R1P3 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Psmb2Q9R1P3 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Psmb2Q9R1P3 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Psmb2Q9R1P3 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Psmb2Q9R1P3 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Psmb2Q9R1P3 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms