Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1A8

Rfwd2, E3 ubiquitin-protein ligase RFWD2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 733 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfwd2Q9R1A8 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Rfwd2Q9R1A8 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Rfwd2Q9R1A8 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Rfwd2Q9R1A8 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Rfwd2Q9R1A8 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Rfwd2Q9R1A8 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Rfwd2Q9R1A8 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Rfwd2Q9R1A8 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Rfwd2Q9R1A8 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Rfwd2Q9R1A8 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Rfwd2Q9R1A8 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Rfwd2Q9R1A8 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Rfwd2Q9R1A8 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Rfwd2Q9R1A8 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Rfwd2Q9R1A8 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Rfwd2Q9R1A8 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Rfwd2Q9R1A8 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Rfwd2Q9R1A8 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Rfwd2Q9R1A8 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Rfwd2Q9R1A8 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Rfwd2Q9R1A8 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Rfwd2Q9R1A8 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Rfwd2Q9R1A8 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Rfwd2Q9R1A8 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Rfwd2Q9R1A8 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Rfwd2Q9R1A8 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Rfwd2Q9R1A8 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Rfwd2Q9R1A8 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Rfwd2Q9R1A8 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Rfwd2Q9R1A8 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Rfwd2Q9R1A8 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Rfwd2Q9R1A8 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Rfwd2Q9R1A8 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Rfwd2Q9R1A8 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Rfwd2Q9R1A8 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Rfwd2Q9R1A8 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Rfwd2Q9R1A8 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Rfwd2Q9R1A8 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Rfwd2Q9R1A8 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Rfwd2Q9R1A8 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Rfwd2Q9R1A8 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Rfwd2Q9R1A8 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Rfwd2Q9R1A8 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Rfwd2Q9R1A8 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Rfwd2Q9R1A8 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Rfwd2Q9R1A8 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Rfwd2Q9R1A8 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Rfwd2Q9R1A8 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Rfwd2Q9R1A8 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Rfwd2Q9R1A8 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Rfwd2Q9R1A8 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Rfwd2Q9R1A8 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Rfwd2Q9R1A8 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Rfwd2Q9R1A8 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Rfwd2Q9R1A8 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Rfwd2Q9R1A8 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Rfwd2Q9R1A8 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Rfwd2Q9R1A8 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Rfwd2Q9R1A8 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Rfwd2Q9R1A8 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Rfwd2Q9R1A8 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Rfwd2Q9R1A8 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Rfwd2Q9R1A8 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Rfwd2Q9R1A8 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Rfwd2Q9R1A8 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Rfwd2Q9R1A8 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Rfwd2Q9R1A8 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Rfwd2Q9R1A8 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Rfwd2Q9R1A8 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Rfwd2Q9R1A8 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Rfwd2Q9R1A8 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Rfwd2Q9R1A8 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Rfwd2Q9R1A8 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Rfwd2Q9R1A8 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Rfwd2Q9R1A8 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Rfwd2Q9R1A8 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Rfwd2Q9R1A8 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Rfwd2Q9R1A8 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Rfwd2Q9R1A8 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
Rfwd2Q9R1A8 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Rfwd2Q9R1A8 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Rfwd2Q9R1A8 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Rfwd2Q9R1A8 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Rfwd2Q9R1A8 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Rfwd2Q9R1A8 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Rfwd2Q9R1A8 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Rfwd2Q9R1A8 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Rfwd2Q9R1A8 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Rfwd2Q9R1A8 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Rfwd2Q9R1A8 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Rfwd2Q9R1A8 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Rfwd2Q9R1A8 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Rfwd2Q9R1A8 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Rfwd2Q9R1A8 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Rfwd2Q9R1A8 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Rfwd2Q9R1A8 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Rfwd2Q9R1A8 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Rfwd2Q9R1A8 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Rfwd2Q9R1A8 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Rfwd2Q9R1A8 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms