Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0M5

Tpk1, Thiamin pyrophosphokinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpk1Q9R0M5 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tpk1Q9R0M5 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tpk1Q9R0M5 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Tpk1Q9R0M5 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tpk1Q9R0M5 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tpk1Q9R0M5 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Tpk1Q9R0M5 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tpk1Q9R0M5 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tpk1Q9R0M5 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tpk1Q9R0M5 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tpk1Q9R0M5 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tpk1Q9R0M5 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tpk1Q9R0M5 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tpk1Q9R0M5 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tpk1Q9R0M5 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tpk1Q9R0M5 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tpk1Q9R0M5 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tpk1Q9R0M5 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tpk1Q9R0M5 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tpk1Q9R0M5 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tpk1Q9R0M5 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tpk1Q9R0M5 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tpk1Q9R0M5 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tpk1Q9R0M5 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tpk1Q9R0M5 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tpk1Q9R0M5 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tpk1Q9R0M5 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tpk1Q9R0M5 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tpk1Q9R0M5 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tpk1Q9R0M5 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tpk1Q9R0M5 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tpk1Q9R0M5 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tpk1Q9R0M5 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tpk1Q9R0M5 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tpk1Q9R0M5 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tpk1Q9R0M5 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tpk1Q9R0M5 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tpk1Q9R0M5 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Tpk1Q9R0M5 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tpk1Q9R0M5 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tpk1Q9R0M5 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tpk1Q9R0M5 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tpk1Q9R0M5 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tpk1Q9R0M5 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Tpk1Q9R0M5 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tpk1Q9R0M5 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tpk1Q9R0M5 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tpk1Q9R0M5 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tpk1Q9R0M5 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tpk1Q9R0M5 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tpk1Q9R0M5 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tpk1Q9R0M5 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tpk1Q9R0M5 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tpk1Q9R0M5 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tpk1Q9R0M5 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tpk1Q9R0M5 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Tpk1Q9R0M5 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tpk1Q9R0M5 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Tpk1Q9R0M5 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tpk1Q9R0M5 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tpk1Q9R0M5 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tpk1Q9R0M5 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tpk1Q9R0M5 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tpk1Q9R0M5 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tpk1Q9R0M5 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tpk1Q9R0M5 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tpk1Q9R0M5 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tpk1Q9R0M5 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tpk1Q9R0M5 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tpk1Q9R0M5 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tpk1Q9R0M5 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tpk1Q9R0M5 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tpk1Q9R0M5 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tpk1Q9R0M5 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tpk1Q9R0M5 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tpk1Q9R0M5 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tpk1Q9R0M5 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tpk1Q9R0M5 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tpk1Q9R0M5 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tpk1Q9R0M5 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tpk1Q9R0M5 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tpk1Q9R0M5 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tpk1Q9R0M5 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tpk1Q9R0M5 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tpk1Q9R0M5 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tpk1Q9R0M5 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Tpk1Q9R0M5 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Tpk1Q9R0M5 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tpk1Q9R0M5 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tpk1Q9R0M5 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tpk1Q9R0M5 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tpk1Q9R0M5 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tpk1Q9R0M5 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tpk1Q9R0M5 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tpk1Q9R0M5 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tpk1Q9R0M5 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tpk1Q9R0M5 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tpk1Q9R0M5 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Tpk1Q9R0M5 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tpk1Q9R0M5 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 379.4 ms