Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0L9

Cd164, Sialomucin core protein 24, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd164Q9R0L9 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd164Q9R0L9 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd164Q9R0L9 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cd164Q9R0L9 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cd164Q9R0L9 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cd164Q9R0L9 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cd164Q9R0L9 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cd164Q9R0L9 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cd164Q9R0L9 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cd164Q9R0L9 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cd164Q9R0L9 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cd164Q9R0L9 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cd164Q9R0L9 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cd164Q9R0L9 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cd164Q9R0L9 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cd164Q9R0L9 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cd164Q9R0L9 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cd164Q9R0L9 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cd164Q9R0L9 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cd164Q9R0L9 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cd164Q9R0L9 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cd164Q9R0L9 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cd164Q9R0L9 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cd164Q9R0L9 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cd164Q9R0L9 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cd164Q9R0L9 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Cd164Q9R0L9 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cd164Q9R0L9 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cd164Q9R0L9 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd164Q9R0L9 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Cd164Q9R0L9 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cd164Q9R0L9 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cd164Q9R0L9 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cd164Q9R0L9 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cd164Q9R0L9 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd164Q9R0L9 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd164Q9R0L9 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd164Q9R0L9 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd164Q9R0L9 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd164Q9R0L9 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd164Q9R0L9 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd164Q9R0L9 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd164Q9R0L9 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd164Q9R0L9 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd164Q9R0L9 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd164Q9R0L9 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd164Q9R0L9 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd164Q9R0L9 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd164Q9R0L9 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd164Q9R0L9 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd164Q9R0L9 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd164Q9R0L9 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd164Q9R0L9 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cd164Q9R0L9 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cd164Q9R0L9 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cd164Q9R0L9 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cd164Q9R0L9 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cd164Q9R0L9 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cd164Q9R0L9 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cd164Q9R0L9 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cd164Q9R0L9 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cd164Q9R0L9 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cd164Q9R0L9 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cd164Q9R0L9 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cd164Q9R0L9 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cd164Q9R0L9 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cd164Q9R0L9 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cd164Q9R0L9 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cd164Q9R0L9 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cd164Q9R0L9 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Cd164Q9R0L9 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cd164Q9R0L9 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cd164Q9R0L9 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cd164Q9R0L9 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cd164Q9R0L9 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cd164Q9R0L9 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cd164Q9R0L9 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cd164Q9R0L9 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cd164Q9R0L9 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cd164Q9R0L9 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cd164Q9R0L9 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cd164Q9R0L9 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cd164Q9R0L9 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cd164Q9R0L9 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cd164Q9R0L9 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cd164Q9R0L9 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cd164Q9R0L9 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cd164Q9R0L9 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cd164Q9R0L9 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd164Q9R0L9 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd164Q9R0L9 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd164Q9R0L9 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd164Q9R0L9 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd164Q9R0L9 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd164Q9R0L9 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd164Q9R0L9 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd164Q9R0L9 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd164Q9R0L9 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd164Q9R0L9 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd164Q9R0L9 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms