Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0A5

Nek3, Serine/threonine-protein kinase Nek3, mousemouse

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek3Q9R0A5 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Nek3Q9R0A5 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Nek3Q9R0A5 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Nek3Q9R0A5 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Nek3Q9R0A5 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Nek3Q9R0A5 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Nek3Q9R0A5 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Nek3Q9R0A5 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Nek3Q9R0A5 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Nek3Q9R0A5 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Nek3Q9R0A5 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Nek3Q9R0A5 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Nek3Q9R0A5 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Nek3Q9R0A5 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
Nek3Q9R0A5 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
Nek3Q9R0A5 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Nek3Q9R0A5 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Nek3Q9R0A5 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Nek3Q9R0A5 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Nek3Q9R0A5 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
Nek3Q9R0A5 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Nek3Q9R0A5 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Nek3Q9R0A5 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Nek3Q9R0A5 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Nek3Q9R0A5 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Nek3Q9R0A5 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Nek3Q9R0A5 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
Nek3Q9R0A5 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Nek3Q9R0A5 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Nek3Q9R0A5 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Nek3Q9R0A5 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Nek3Q9R0A5 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Nek3Q9R0A5 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Nek3Q9R0A5 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Nek3Q9R0A5 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
Nek3Q9R0A5 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
Nek3Q9R0A5 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Nek3Q9R0A5 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Nek3Q9R0A5 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Nek3Q9R0A5 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Nek3Q9R0A5 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Nek3Q9R0A5 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Nek3Q9R0A5 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Nek3Q9R0A5 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Nek3Q9R0A5 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Nek3Q9R0A5 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Nek3Q9R0A5 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.16
Nek3Q9R0A5 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Nek3Q9R0A5 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Nek3Q9R0A5 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Nek3Q9R0A5 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Nek3Q9R0A5 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Nek3Q9R0A5 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Nek3Q9R0A5 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
Nek3Q9R0A5 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Nek3Q9R0A5 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Nek3Q9R0A5 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Nek3Q9R0A5 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Nek3Q9R0A5 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Nek3Q9R0A5 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Nek3Q9R0A5 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Nek3Q9R0A5 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Nek3Q9R0A5 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Nek3Q9R0A5 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Nek3Q9R0A5 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Nek3Q9R0A5 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Nek3Q9R0A5 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Nek3Q9R0A5 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Nek3Q9R0A5 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Nek3Q9R0A5 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Nek3Q9R0A5 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Nek3Q9R0A5 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Nek3Q9R0A5 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Nek3Q9R0A5 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Nek3Q9R0A5 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Nek3Q9R0A5 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Nek3Q9R0A5 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Nek3Q9R0A5 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Nek3Q9R0A5 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Nek3Q9R0A5 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Nek3Q9R0A5 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Nek3Q9R0A5 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Nek3Q9R0A5 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Nek3Q9R0A5 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Nek3Q9R0A5 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Nek3Q9R0A5 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Nek3Q9R0A5 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Nek3Q9R0A5 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Nek3Q9R0A5 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Nek3Q9R0A5 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Nek3Q9R0A5 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Nek3Q9R0A5 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Nek3Q9R0A5 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Nek3Q9R0A5 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Nek3Q9R0A5 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Nek3Q9R0A5 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Nek3Q9R0A5 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Nek3Q9R0A5 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
Nek3Q9R0A5 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Nek3Q9R0A5 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms