Protein–RNA interactions for Protein: Q9R060

Nubp1, Cytosolic Fe-S cluster assembly factor NUBP1, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nubp1Q9R060 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Nubp1Q9R060 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Nubp1Q9R060 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nubp1Q9R060 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nubp1Q9R060 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nubp1Q9R060 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nubp1Q9R060 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nubp1Q9R060 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nubp1Q9R060 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nubp1Q9R060 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nubp1Q9R060 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nubp1Q9R060 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Nubp1Q9R060 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nubp1Q9R060 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Nubp1Q9R060 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nubp1Q9R060 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nubp1Q9R060 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nubp1Q9R060 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nubp1Q9R060 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nubp1Q9R060 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nubp1Q9R060 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nubp1Q9R060 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nubp1Q9R060 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nubp1Q9R060 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nubp1Q9R060 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nubp1Q9R060 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nubp1Q9R060 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nubp1Q9R060 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nubp1Q9R060 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nubp1Q9R060 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nubp1Q9R060 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nubp1Q9R060 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nubp1Q9R060 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nubp1Q9R060 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nubp1Q9R060 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nubp1Q9R060 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nubp1Q9R060 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nubp1Q9R060 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nubp1Q9R060 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nubp1Q9R060 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nubp1Q9R060 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nubp1Q9R060 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nubp1Q9R060 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nubp1Q9R060 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nubp1Q9R060 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nubp1Q9R060 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nubp1Q9R060 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nubp1Q9R060 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nubp1Q9R060 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nubp1Q9R060 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nubp1Q9R060 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nubp1Q9R060 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nubp1Q9R060 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nubp1Q9R060 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nubp1Q9R060 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Nubp1Q9R060 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Nubp1Q9R060 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nubp1Q9R060 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nubp1Q9R060 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nubp1Q9R060 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nubp1Q9R060 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nubp1Q9R060 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nubp1Q9R060 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nubp1Q9R060 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nubp1Q9R060 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Nubp1Q9R060 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nubp1Q9R060 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nubp1Q9R060 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nubp1Q9R060 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Nubp1Q9R060 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nubp1Q9R060 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nubp1Q9R060 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nubp1Q9R060 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nubp1Q9R060 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nubp1Q9R060 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nubp1Q9R060 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nubp1Q9R060 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Nubp1Q9R060 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nubp1Q9R060 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nubp1Q9R060 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Nubp1Q9R060 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nubp1Q9R060 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nubp1Q9R060 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nubp1Q9R060 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nubp1Q9R060 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nubp1Q9R060 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nubp1Q9R060 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nubp1Q9R060 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Nubp1Q9R060 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Nubp1Q9R060 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nubp1Q9R060 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nubp1Q9R060 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nubp1Q9R060 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Nubp1Q9R060 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nubp1Q9R060 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nubp1Q9R060 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nubp1Q9R060 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nubp1Q9R060 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nubp1Q9R060 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Nubp1Q9R060 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1106.7 ms