Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS8

Sh2d3c, SH2 domain-containing protein 3C, mousemouse

Predictions only

Length 854 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh2d3cQ9QZS8 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Sh2d3cQ9QZS8 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Sh2d3cQ9QZS8 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Sh2d3cQ9QZS8 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Sh2d3cQ9QZS8 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Sh2d3cQ9QZS8 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Sh2d3cQ9QZS8 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Sh2d3cQ9QZS8 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Sh2d3cQ9QZS8 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Sh2d3cQ9QZS8 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Sh2d3cQ9QZS8 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Sh2d3cQ9QZS8 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Sh2d3cQ9QZS8 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Sh2d3cQ9QZS8 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Sh2d3cQ9QZS8 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Sh2d3cQ9QZS8 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Sh2d3cQ9QZS8 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Sh2d3cQ9QZS8 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Sh2d3cQ9QZS8 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Sh2d3cQ9QZS8 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Sh2d3cQ9QZS8 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Sh2d3cQ9QZS8 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Sh2d3cQ9QZS8 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Sh2d3cQ9QZS8 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Sh2d3cQ9QZS8 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Sh2d3cQ9QZS8 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Sh2d3cQ9QZS8 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Sh2d3cQ9QZS8 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Sh2d3cQ9QZS8 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Sh2d3cQ9QZS8 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Sh2d3cQ9QZS8 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Sh2d3cQ9QZS8 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Sh2d3cQ9QZS8 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Sh2d3cQ9QZS8 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Sh2d3cQ9QZS8 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Sh2d3cQ9QZS8 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Sh2d3cQ9QZS8 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Sh2d3cQ9QZS8 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Sh2d3cQ9QZS8 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Sh2d3cQ9QZS8 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Sh2d3cQ9QZS8 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Sh2d3cQ9QZS8 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Sh2d3cQ9QZS8 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Sh2d3cQ9QZS8 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Sh2d3cQ9QZS8 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Sh2d3cQ9QZS8 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Sh2d3cQ9QZS8 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Sh2d3cQ9QZS8 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Sh2d3cQ9QZS8 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Sh2d3cQ9QZS8 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Sh2d3cQ9QZS8 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Sh2d3cQ9QZS8 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Sh2d3cQ9QZS8 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Sh2d3cQ9QZS8 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Sh2d3cQ9QZS8 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Sh2d3cQ9QZS8 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Sh2d3cQ9QZS8 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Sh2d3cQ9QZS8 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Sh2d3cQ9QZS8 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Sh2d3cQ9QZS8 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Sh2d3cQ9QZS8 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Sh2d3cQ9QZS8 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Sh2d3cQ9QZS8 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Sh2d3cQ9QZS8 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Sh2d3cQ9QZS8 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Sh2d3cQ9QZS8 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Sh2d3cQ9QZS8 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Sh2d3cQ9QZS8 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Sh2d3cQ9QZS8 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Sh2d3cQ9QZS8 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Sh2d3cQ9QZS8 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Sh2d3cQ9QZS8 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Sh2d3cQ9QZS8 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Sh2d3cQ9QZS8 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Sh2d3cQ9QZS8 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Sh2d3cQ9QZS8 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Sh2d3cQ9QZS8 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sh2d3cQ9QZS8 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Sh2d3cQ9QZS8 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Sh2d3cQ9QZS8 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Sh2d3cQ9QZS8 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Sh2d3cQ9QZS8 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Sh2d3cQ9QZS8 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Sh2d3cQ9QZS8 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Sh2d3cQ9QZS8 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sh2d3cQ9QZS8 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sh2d3cQ9QZS8 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sh2d3cQ9QZS8 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sh2d3cQ9QZS8 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sh2d3cQ9QZS8 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Sh2d3cQ9QZS8 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sh2d3cQ9QZS8 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sh2d3cQ9QZS8 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sh2d3cQ9QZS8 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sh2d3cQ9QZS8 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Sh2d3cQ9QZS8 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Sh2d3cQ9QZS8 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Sh2d3cQ9QZS8 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Sh2d3cQ9QZS8 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Sh2d3cQ9QZS8 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms