Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYY8

Spast, Spastin, mousemouse

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SpastQ9QYY8 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SpastQ9QYY8 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SpastQ9QYY8 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SpastQ9QYY8 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SpastQ9QYY8 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SpastQ9QYY8 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SpastQ9QYY8 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SpastQ9QYY8 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SpastQ9QYY8 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SpastQ9QYY8 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SpastQ9QYY8 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SpastQ9QYY8 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
SpastQ9QYY8 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SpastQ9QYY8 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SpastQ9QYY8 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
SpastQ9QYY8 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SpastQ9QYY8 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SpastQ9QYY8 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SpastQ9QYY8 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SpastQ9QYY8 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SpastQ9QYY8 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SpastQ9QYY8 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SpastQ9QYY8 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SpastQ9QYY8 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SpastQ9QYY8 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
SpastQ9QYY8 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SpastQ9QYY8 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SpastQ9QYY8 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SpastQ9QYY8 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SpastQ9QYY8 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SpastQ9QYY8 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SpastQ9QYY8 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SpastQ9QYY8 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SpastQ9QYY8 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SpastQ9QYY8 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SpastQ9QYY8 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
SpastQ9QYY8 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.39
SpastQ9QYY8 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SpastQ9QYY8 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SpastQ9QYY8 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SpastQ9QYY8 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SpastQ9QYY8 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SpastQ9QYY8 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SpastQ9QYY8 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SpastQ9QYY8 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SpastQ9QYY8 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SpastQ9QYY8 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SpastQ9QYY8 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SpastQ9QYY8 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SpastQ9QYY8 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SpastQ9QYY8 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SpastQ9QYY8 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SpastQ9QYY8 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SpastQ9QYY8 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SpastQ9QYY8 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SpastQ9QYY8 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SpastQ9QYY8 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SpastQ9QYY8 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SpastQ9QYY8 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SpastQ9QYY8 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SpastQ9QYY8 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SpastQ9QYY8 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SpastQ9QYY8 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SpastQ9QYY8 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SpastQ9QYY8 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SpastQ9QYY8 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SpastQ9QYY8 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SpastQ9QYY8 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SpastQ9QYY8 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SpastQ9QYY8 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SpastQ9QYY8 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SpastQ9QYY8 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SpastQ9QYY8 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SpastQ9QYY8 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SpastQ9QYY8 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SpastQ9QYY8 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SpastQ9QYY8 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SpastQ9QYY8 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SpastQ9QYY8 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SpastQ9QYY8 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SpastQ9QYY8 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SpastQ9QYY8 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SpastQ9QYY8 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SpastQ9QYY8 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SpastQ9QYY8 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SpastQ9QYY8 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SpastQ9QYY8 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SpastQ9QYY8 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SpastQ9QYY8 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SpastQ9QYY8 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SpastQ9QYY8 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SpastQ9QYY8 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SpastQ9QYY8 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SpastQ9QYY8 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SpastQ9QYY8 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SpastQ9QYY8 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SpastQ9QYY8 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SpastQ9QYY8 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SpastQ9QYY8 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SpastQ9QYY8 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10 ms