Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYM5

Rnd2, Rho-related GTP-binding protein RhoN, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnd2Q9QYM5 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rnd2Q9QYM5 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rnd2Q9QYM5 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rnd2Q9QYM5 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rnd2Q9QYM5 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Rnd2Q9QYM5 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Rnd2Q9QYM5 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rnd2Q9QYM5 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rnd2Q9QYM5 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rnd2Q9QYM5 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rnd2Q9QYM5 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rnd2Q9QYM5 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Rnd2Q9QYM5 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rnd2Q9QYM5 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Rnd2Q9QYM5 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Rnd2Q9QYM5 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rnd2Q9QYM5 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rnd2Q9QYM5 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Rnd2Q9QYM5 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Rnd2Q9QYM5 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Rnd2Q9QYM5 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Rnd2Q9QYM5 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rnd2Q9QYM5 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rnd2Q9QYM5 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rnd2Q9QYM5 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rnd2Q9QYM5 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rnd2Q9QYM5 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rnd2Q9QYM5 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rnd2Q9QYM5 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rnd2Q9QYM5 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rnd2Q9QYM5 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Rnd2Q9QYM5 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rnd2Q9QYM5 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rnd2Q9QYM5 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rnd2Q9QYM5 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rnd2Q9QYM5 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rnd2Q9QYM5 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rnd2Q9QYM5 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rnd2Q9QYM5 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rnd2Q9QYM5 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rnd2Q9QYM5 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rnd2Q9QYM5 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rnd2Q9QYM5 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Rnd2Q9QYM5 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Rnd2Q9QYM5 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rnd2Q9QYM5 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rnd2Q9QYM5 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rnd2Q9QYM5 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rnd2Q9QYM5 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rnd2Q9QYM5 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rnd2Q9QYM5 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rnd2Q9QYM5 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rnd2Q9QYM5 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rnd2Q9QYM5 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rnd2Q9QYM5 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rnd2Q9QYM5 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rnd2Q9QYM5 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rnd2Q9QYM5 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rnd2Q9QYM5 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rnd2Q9QYM5 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rnd2Q9QYM5 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rnd2Q9QYM5 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rnd2Q9QYM5 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rnd2Q9QYM5 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rnd2Q9QYM5 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rnd2Q9QYM5 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rnd2Q9QYM5 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rnd2Q9QYM5 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Rnd2Q9QYM5 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rnd2Q9QYM5 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rnd2Q9QYM5 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rnd2Q9QYM5 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rnd2Q9QYM5 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rnd2Q9QYM5 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rnd2Q9QYM5 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rnd2Q9QYM5 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rnd2Q9QYM5 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rnd2Q9QYM5 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rnd2Q9QYM5 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rnd2Q9QYM5 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rnd2Q9QYM5 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rnd2Q9QYM5 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rnd2Q9QYM5 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
Rnd2Q9QYM5 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rnd2Q9QYM5 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rnd2Q9QYM5 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rnd2Q9QYM5 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rnd2Q9QYM5 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Rnd2Q9QYM5 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rnd2Q9QYM5 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rnd2Q9QYM5 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rnd2Q9QYM5 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rnd2Q9QYM5 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rnd2Q9QYM5 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rnd2Q9QYM5 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rnd2Q9QYM5 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rnd2Q9QYM5 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rnd2Q9QYM5 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rnd2Q9QYM5 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rnd2Q9QYM5 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.2 ms