Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY76

Vapb, Vesicle-associated membrane protein-associated protein B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VapbQ9QY76 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
VapbQ9QY76 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
VapbQ9QY76 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
VapbQ9QY76 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
VapbQ9QY76 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
VapbQ9QY76 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
VapbQ9QY76 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
VapbQ9QY76 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
VapbQ9QY76 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
VapbQ9QY76 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
VapbQ9QY76 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
VapbQ9QY76 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
VapbQ9QY76 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
VapbQ9QY76 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
VapbQ9QY76 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
VapbQ9QY76 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
VapbQ9QY76 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
VapbQ9QY76 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
VapbQ9QY76 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
VapbQ9QY76 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
VapbQ9QY76 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
VapbQ9QY76 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
VapbQ9QY76 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
VapbQ9QY76 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
VapbQ9QY76 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
VapbQ9QY76 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
VapbQ9QY76 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
VapbQ9QY76 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
VapbQ9QY76 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
VapbQ9QY76 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
VapbQ9QY76 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.6
VapbQ9QY76 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
VapbQ9QY76 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
VapbQ9QY76 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
VapbQ9QY76 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
VapbQ9QY76 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
VapbQ9QY76 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
VapbQ9QY76 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
VapbQ9QY76 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
VapbQ9QY76 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
VapbQ9QY76 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
VapbQ9QY76 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
VapbQ9QY76 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
VapbQ9QY76 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
VapbQ9QY76 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
VapbQ9QY76 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
VapbQ9QY76 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
VapbQ9QY76 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
VapbQ9QY76 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
VapbQ9QY76 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
VapbQ9QY76 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
VapbQ9QY76 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
VapbQ9QY76 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
VapbQ9QY76 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
VapbQ9QY76 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
VapbQ9QY76 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
VapbQ9QY76 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
VapbQ9QY76 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
VapbQ9QY76 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
VapbQ9QY76 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
VapbQ9QY76 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
VapbQ9QY76 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
VapbQ9QY76 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
VapbQ9QY76 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
VapbQ9QY76 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
VapbQ9QY76 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
VapbQ9QY76 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
VapbQ9QY76 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
VapbQ9QY76 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
VapbQ9QY76 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
VapbQ9QY76 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
VapbQ9QY76 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
VapbQ9QY76 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
VapbQ9QY76 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
VapbQ9QY76 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
VapbQ9QY76 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
VapbQ9QY76 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
VapbQ9QY76 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
VapbQ9QY76 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
VapbQ9QY76 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
VapbQ9QY76 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
VapbQ9QY76 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
VapbQ9QY76 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
VapbQ9QY76 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
VapbQ9QY76 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
VapbQ9QY76 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
VapbQ9QY76 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
VapbQ9QY76 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
VapbQ9QY76 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
VapbQ9QY76 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
VapbQ9QY76 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
VapbQ9QY76 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
VapbQ9QY76 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
VapbQ9QY76 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
VapbQ9QY76 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
VapbQ9QY76 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
VapbQ9QY76 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
VapbQ9QY76 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
VapbQ9QY76 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
VapbQ9QY76 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms