Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY31

Snai3, Zinc finger protein SNAI3, mousemouse

Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snai3Q9QY31 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Snai3Q9QY31 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Snai3Q9QY31 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Snai3Q9QY31 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Snai3Q9QY31 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Snai3Q9QY31 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Snai3Q9QY31 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Snai3Q9QY31 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Snai3Q9QY31 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Snai3Q9QY31 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Snai3Q9QY31 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Snai3Q9QY31 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Snai3Q9QY31 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Snai3Q9QY31 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Snai3Q9QY31 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Snai3Q9QY31 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Snai3Q9QY31 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Snai3Q9QY31 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Snai3Q9QY31 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Snai3Q9QY31 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Snai3Q9QY31 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Snai3Q9QY31 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Snai3Q9QY31 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Snai3Q9QY31 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Snai3Q9QY31 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Snai3Q9QY31 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Snai3Q9QY31 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Snai3Q9QY31 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Snai3Q9QY31 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Snai3Q9QY31 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Snai3Q9QY31 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Snai3Q9QY31 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Snai3Q9QY31 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Snai3Q9QY31 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Snai3Q9QY31 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Snai3Q9QY31 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Snai3Q9QY31 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Snai3Q9QY31 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Snai3Q9QY31 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Snai3Q9QY31 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Snai3Q9QY31 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Snai3Q9QY31 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Snai3Q9QY31 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Snai3Q9QY31 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Snai3Q9QY31 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Snai3Q9QY31 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Snai3Q9QY31 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Snai3Q9QY31 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Snai3Q9QY31 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snai3Q9QY31 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snai3Q9QY31 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Snai3Q9QY31 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Snai3Q9QY31 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Snai3Q9QY31 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Snai3Q9QY31 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snai3Q9QY31 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Snai3Q9QY31 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Snai3Q9QY31 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Snai3Q9QY31 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snai3Q9QY31 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Snai3Q9QY31 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snai3Q9QY31 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snai3Q9QY31 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snai3Q9QY31 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snai3Q9QY31 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snai3Q9QY31 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snai3Q9QY31 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snai3Q9QY31 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Snai3Q9QY31 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snai3Q9QY31 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snai3Q9QY31 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snai3Q9QY31 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snai3Q9QY31 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Snai3Q9QY31 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Snai3Q9QY31 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Snai3Q9QY31 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Snai3Q9QY31 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Snai3Q9QY31 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Snai3Q9QY31 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Snai3Q9QY31 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Snai3Q9QY31 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Snai3Q9QY31 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Snai3Q9QY31 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Snai3Q9QY31 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Snai3Q9QY31 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Snai3Q9QY31 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Snai3Q9QY31 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Snai3Q9QY31 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Snai3Q9QY31 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Snai3Q9QY31 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Snai3Q9QY31 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Snai3Q9QY31 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Snai3Q9QY31 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Snai3Q9QY31 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Snai3Q9QY31 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Snai3Q9QY31 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Snai3Q9QY31 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snai3Q9QY31 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snai3Q9QY31 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snai3Q9QY31 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms