Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXG9

Tinf2, TERF1-interacting nuclear factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tinf2Q9QXG9 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tinf2Q9QXG9 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tinf2Q9QXG9 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tinf2Q9QXG9 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tinf2Q9QXG9 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tinf2Q9QXG9 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tinf2Q9QXG9 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tinf2Q9QXG9 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tinf2Q9QXG9 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tinf2Q9QXG9 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tinf2Q9QXG9 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tinf2Q9QXG9 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tinf2Q9QXG9 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tinf2Q9QXG9 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tinf2Q9QXG9 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tinf2Q9QXG9 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tinf2Q9QXG9 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tinf2Q9QXG9 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tinf2Q9QXG9 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tinf2Q9QXG9 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tinf2Q9QXG9 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tinf2Q9QXG9 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tinf2Q9QXG9 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Tinf2Q9QXG9 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tinf2Q9QXG9 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tinf2Q9QXG9 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tinf2Q9QXG9 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tinf2Q9QXG9 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tinf2Q9QXG9 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tinf2Q9QXG9 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tinf2Q9QXG9 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tinf2Q9QXG9 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tinf2Q9QXG9 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tinf2Q9QXG9 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tinf2Q9QXG9 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tinf2Q9QXG9 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tinf2Q9QXG9 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tinf2Q9QXG9 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tinf2Q9QXG9 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tinf2Q9QXG9 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tinf2Q9QXG9 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tinf2Q9QXG9 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tinf2Q9QXG9 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tinf2Q9QXG9 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tinf2Q9QXG9 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tinf2Q9QXG9 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tinf2Q9QXG9 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tinf2Q9QXG9 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tinf2Q9QXG9 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tinf2Q9QXG9 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tinf2Q9QXG9 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tinf2Q9QXG9 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tinf2Q9QXG9 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tinf2Q9QXG9 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tinf2Q9QXG9 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tinf2Q9QXG9 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tinf2Q9QXG9 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tinf2Q9QXG9 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tinf2Q9QXG9 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tinf2Q9QXG9 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tinf2Q9QXG9 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tinf2Q9QXG9 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tinf2Q9QXG9 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tinf2Q9QXG9 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tinf2Q9QXG9 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tinf2Q9QXG9 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tinf2Q9QXG9 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tinf2Q9QXG9 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tinf2Q9QXG9 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tinf2Q9QXG9 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tinf2Q9QXG9 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tinf2Q9QXG9 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Tinf2Q9QXG9 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tinf2Q9QXG9 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Tinf2Q9QXG9 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tinf2Q9QXG9 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Tinf2Q9QXG9 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tinf2Q9QXG9 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tinf2Q9QXG9 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tinf2Q9QXG9 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tinf2Q9QXG9 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tinf2Q9QXG9 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tinf2Q9QXG9 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tinf2Q9QXG9 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tinf2Q9QXG9 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tinf2Q9QXG9 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tinf2Q9QXG9 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tinf2Q9QXG9 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tinf2Q9QXG9 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tinf2Q9QXG9 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tinf2Q9QXG9 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tinf2Q9QXG9 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tinf2Q9QXG9 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tinf2Q9QXG9 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tinf2Q9QXG9 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tinf2Q9QXG9 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tinf2Q9QXG9 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tinf2Q9QXG9 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Tinf2Q9QXG9 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tinf2Q9QXG9 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms