Protein–RNA interactions for Protein: Q9QX98

Ptf1a, Pancreas transcription factor 1 subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 324 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptf1aQ9QX98 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC32.75■■■□□ 2.83
Ptf1aQ9QX98 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC32.75■■■□□ 2.83
Ptf1aQ9QX98 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Ptf1aQ9QX98 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Ptf1aQ9QX98 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Ptf1aQ9QX98 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Ptf1aQ9QX98 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Ptf1aQ9QX98 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Ptf1aQ9QX98 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Ptf1aQ9QX98 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
Ptf1aQ9QX98 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Ptf1aQ9QX98 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC32.56■■■□□ 2.8
Ptf1aQ9QX98 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Ptf1aQ9QX98 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Ptf1aQ9QX98 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Ptf1aQ9QX98 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.8
Ptf1aQ9QX98 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
Ptf1aQ9QX98 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Ptf1aQ9QX98 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC32.47■■■□□ 2.79
Ptf1aQ9QX98 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Ptf1aQ9QX98 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
Ptf1aQ9QX98 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.79
Ptf1aQ9QX98 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Ptf1aQ9QX98 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC32.44■■■□□ 2.78
Ptf1aQ9QX98 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Ptf1aQ9QX98 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Ptf1aQ9QX98 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Ptf1aQ9QX98 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Ptf1aQ9QX98 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
Ptf1aQ9QX98 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Ptf1aQ9QX98 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
Ptf1aQ9QX98 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Ptf1aQ9QX98 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Ptf1aQ9QX98 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.35■■■□□ 2.77
Ptf1aQ9QX98 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
Ptf1aQ9QX98 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Ptf1aQ9QX98 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Ptf1aQ9QX98 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC32.32■■■□□ 2.76
Ptf1aQ9QX98 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Ptf1aQ9QX98 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
Ptf1aQ9QX98 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Ptf1aQ9QX98 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Ptf1aQ9QX98 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
Ptf1aQ9QX98 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
Ptf1aQ9QX98 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC32.24■■■□□ 2.75
Ptf1aQ9QX98 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC32.24■■■□□ 2.75
Ptf1aQ9QX98 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Ptf1aQ9QX98 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Ptf1aQ9QX98 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Ptf1aQ9QX98 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Ptf1aQ9QX98 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC32.2■■■□□ 2.75
Ptf1aQ9QX98 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Ptf1aQ9QX98 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Ptf1aQ9QX98 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Ptf1aQ9QX98 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC32.15■■■□□ 2.74
Ptf1aQ9QX98 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC32.14■■■□□ 2.74
Ptf1aQ9QX98 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Ptf1aQ9QX98 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Ptf1aQ9QX98 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Ptf1aQ9QX98 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Ptf1aQ9QX98 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
Ptf1aQ9QX98 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Ptf1aQ9QX98 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC32.09■■■□□ 2.73
Ptf1aQ9QX98 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC32.07■■■□□ 2.72
Ptf1aQ9QX98 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC32.05■■■□□ 2.72
Ptf1aQ9QX98 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
Ptf1aQ9QX98 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
Ptf1aQ9QX98 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Ptf1aQ9QX98 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC31.95■■■□□ 2.71
Ptf1aQ9QX98 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC31.94■■■□□ 2.7
Ptf1aQ9QX98 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC31.93■■■□□ 2.7
Ptf1aQ9QX98 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
Ptf1aQ9QX98 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC31.91■■■□□ 2.7
Ptf1aQ9QX98 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC31.89■■■□□ 2.7
Ptf1aQ9QX98 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.87■■■□□ 2.69
Ptf1aQ9QX98 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
Ptf1aQ9QX98 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
Ptf1aQ9QX98 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.82■■■□□ 2.68
Ptf1aQ9QX98 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC31.79■■■□□ 2.68
Ptf1aQ9QX98 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
Ptf1aQ9QX98 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC31.79■■■□□ 2.68
Ptf1aQ9QX98 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
Ptf1aQ9QX98 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC31.77■■■□□ 2.68
Ptf1aQ9QX98 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
Ptf1aQ9QX98 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
Ptf1aQ9QX98 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC31.73■■■□□ 2.67
Ptf1aQ9QX98 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
Ptf1aQ9QX98 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC31.7■■■□□ 2.67
Ptf1aQ9QX98 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC31.68■■■□□ 2.66
Ptf1aQ9QX98 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
Ptf1aQ9QX98 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Ptf1aQ9QX98 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC31.66■■■□□ 2.66
Ptf1aQ9QX98 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC31.66■■■□□ 2.66
Ptf1aQ9QX98 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
Ptf1aQ9QX98 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
Ptf1aQ9QX98 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
Ptf1aQ9QX98 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
Ptf1aQ9QX98 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Ptf1aQ9QX98 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC31.62■■■□□ 2.65
Ptf1aQ9QX98 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.5 ms