Protein–RNA interactions for Protein: Q9QWL7

Krt17, Keratin, type I cytoskeletal 17, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt17Q9QWL7 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Krt17Q9QWL7 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Krt17Q9QWL7 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Krt17Q9QWL7 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
Krt17Q9QWL7 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Krt17Q9QWL7 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
Krt17Q9QWL7 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Krt17Q9QWL7 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Krt17Q9QWL7 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Krt17Q9QWL7 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Krt17Q9QWL7 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Krt17Q9QWL7 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Krt17Q9QWL7 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Krt17Q9QWL7 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Krt17Q9QWL7 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Krt17Q9QWL7 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Krt17Q9QWL7 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Krt17Q9QWL7 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Krt17Q9QWL7 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Krt17Q9QWL7 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Krt17Q9QWL7 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Krt17Q9QWL7 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Krt17Q9QWL7 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Krt17Q9QWL7 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Krt17Q9QWL7 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Krt17Q9QWL7 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Krt17Q9QWL7 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
Krt17Q9QWL7 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Krt17Q9QWL7 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Krt17Q9QWL7 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Krt17Q9QWL7 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Krt17Q9QWL7 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Krt17Q9QWL7 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Krt17Q9QWL7 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Krt17Q9QWL7 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Krt17Q9QWL7 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Krt17Q9QWL7 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Krt17Q9QWL7 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Krt17Q9QWL7 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Krt17Q9QWL7 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
Krt17Q9QWL7 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Krt17Q9QWL7 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
Krt17Q9QWL7 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Krt17Q9QWL7 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Krt17Q9QWL7 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Krt17Q9QWL7 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Krt17Q9QWL7 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Krt17Q9QWL7 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Krt17Q9QWL7 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Krt17Q9QWL7 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Krt17Q9QWL7 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Krt17Q9QWL7 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Krt17Q9QWL7 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Krt17Q9QWL7 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Krt17Q9QWL7 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Krt17Q9QWL7 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Krt17Q9QWL7 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Krt17Q9QWL7 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Krt17Q9QWL7 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
Krt17Q9QWL7 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Krt17Q9QWL7 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Krt17Q9QWL7 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Krt17Q9QWL7 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Krt17Q9QWL7 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Krt17Q9QWL7 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Krt17Q9QWL7 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Krt17Q9QWL7 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Krt17Q9QWL7 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Krt17Q9QWL7 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Krt17Q9QWL7 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Krt17Q9QWL7 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Krt17Q9QWL7 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Krt17Q9QWL7 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Krt17Q9QWL7 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Krt17Q9QWL7 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Krt17Q9QWL7 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Krt17Q9QWL7 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Krt17Q9QWL7 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Krt17Q9QWL7 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Krt17Q9QWL7 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Krt17Q9QWL7 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Krt17Q9QWL7 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Krt17Q9QWL7 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Krt17Q9QWL7 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Krt17Q9QWL7 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Krt17Q9QWL7 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Krt17Q9QWL7 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Krt17Q9QWL7 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Krt17Q9QWL7 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Krt17Q9QWL7 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Krt17Q9QWL7 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Krt17Q9QWL7 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Krt17Q9QWL7 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Krt17Q9QWL7 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Krt17Q9QWL7 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Krt17Q9QWL7 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Krt17Q9QWL7 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Krt17Q9QWL7 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Krt17Q9QWL7 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Krt17Q9QWL7 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms