Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUN9

Dkk3, Dickkopf-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dkk3Q9QUN9 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Dkk3Q9QUN9 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Dkk3Q9QUN9 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Dkk3Q9QUN9 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Dkk3Q9QUN9 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Dkk3Q9QUN9 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Dkk3Q9QUN9 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Dkk3Q9QUN9 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Dkk3Q9QUN9 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Dkk3Q9QUN9 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Dkk3Q9QUN9 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Dkk3Q9QUN9 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Dkk3Q9QUN9 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Dkk3Q9QUN9 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Dkk3Q9QUN9 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Dkk3Q9QUN9 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Dkk3Q9QUN9 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Dkk3Q9QUN9 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Dkk3Q9QUN9 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Dkk3Q9QUN9 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Dkk3Q9QUN9 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Dkk3Q9QUN9 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Dkk3Q9QUN9 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Dkk3Q9QUN9 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Dkk3Q9QUN9 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Dkk3Q9QUN9 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Dkk3Q9QUN9 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Dkk3Q9QUN9 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Dkk3Q9QUN9 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Dkk3Q9QUN9 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Dkk3Q9QUN9 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Dkk3Q9QUN9 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Dkk3Q9QUN9 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Dkk3Q9QUN9 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Dkk3Q9QUN9 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Dkk3Q9QUN9 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Dkk3Q9QUN9 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Dkk3Q9QUN9 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Dkk3Q9QUN9 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Dkk3Q9QUN9 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Dkk3Q9QUN9 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Dkk3Q9QUN9 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Dkk3Q9QUN9 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Dkk3Q9QUN9 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Dkk3Q9QUN9 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Dkk3Q9QUN9 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Dkk3Q9QUN9 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Dkk3Q9QUN9 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Dkk3Q9QUN9 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Dkk3Q9QUN9 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Dkk3Q9QUN9 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Dkk3Q9QUN9 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Dkk3Q9QUN9 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Dkk3Q9QUN9 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Dkk3Q9QUN9 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Dkk3Q9QUN9 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Dkk3Q9QUN9 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Dkk3Q9QUN9 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Dkk3Q9QUN9 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Dkk3Q9QUN9 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Dkk3Q9QUN9 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Dkk3Q9QUN9 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Dkk3Q9QUN9 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Dkk3Q9QUN9 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Dkk3Q9QUN9 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Dkk3Q9QUN9 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Dkk3Q9QUN9 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Dkk3Q9QUN9 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Dkk3Q9QUN9 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Dkk3Q9QUN9 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Dkk3Q9QUN9 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Dkk3Q9QUN9 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Dkk3Q9QUN9 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Dkk3Q9QUN9 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Dkk3Q9QUN9 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Dkk3Q9QUN9 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Dkk3Q9QUN9 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Dkk3Q9QUN9 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Dkk3Q9QUN9 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Dkk3Q9QUN9 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Dkk3Q9QUN9 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Dkk3Q9QUN9 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Dkk3Q9QUN9 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Dkk3Q9QUN9 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Dkk3Q9QUN9 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Dkk3Q9QUN9 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Dkk3Q9QUN9 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Dkk3Q9QUN9 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Dkk3Q9QUN9 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Dkk3Q9QUN9 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Dkk3Q9QUN9 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Dkk3Q9QUN9 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Dkk3Q9QUN9 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Dkk3Q9QUN9 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Dkk3Q9QUN9 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Dkk3Q9QUN9 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Dkk3Q9QUN9 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Dkk3Q9QUN9 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Dkk3Q9QUN9 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Dkk3Q9QUN9 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms