Protein–RNA interactions for Protein: Q9JME7

Trappc2l, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc2lQ9JME7 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trappc2lQ9JME7 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trappc2lQ9JME7 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trappc2lQ9JME7 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Trappc2lQ9JME7 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Trappc2lQ9JME7 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trappc2lQ9JME7 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trappc2lQ9JME7 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trappc2lQ9JME7 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trappc2lQ9JME7 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trappc2lQ9JME7 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trappc2lQ9JME7 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trappc2lQ9JME7 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trappc2lQ9JME7 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trappc2lQ9JME7 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trappc2lQ9JME7 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trappc2lQ9JME7 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trappc2lQ9JME7 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trappc2lQ9JME7 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trappc2lQ9JME7 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trappc2lQ9JME7 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trappc2lQ9JME7 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trappc2lQ9JME7 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Trappc2lQ9JME7 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trappc2lQ9JME7 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trappc2lQ9JME7 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Trappc2lQ9JME7 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trappc2lQ9JME7 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trappc2lQ9JME7 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trappc2lQ9JME7 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trappc2lQ9JME7 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trappc2lQ9JME7 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trappc2lQ9JME7 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trappc2lQ9JME7 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trappc2lQ9JME7 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Trappc2lQ9JME7 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trappc2lQ9JME7 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trappc2lQ9JME7 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trappc2lQ9JME7 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trappc2lQ9JME7 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trappc2lQ9JME7 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trappc2lQ9JME7 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trappc2lQ9JME7 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trappc2lQ9JME7 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trappc2lQ9JME7 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trappc2lQ9JME7 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trappc2lQ9JME7 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Trappc2lQ9JME7 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trappc2lQ9JME7 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trappc2lQ9JME7 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Trappc2lQ9JME7 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Trappc2lQ9JME7 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trappc2lQ9JME7 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trappc2lQ9JME7 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trappc2lQ9JME7 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Trappc2lQ9JME7 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Trappc2lQ9JME7 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Trappc2lQ9JME7 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Trappc2lQ9JME7 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Trappc2lQ9JME7 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Trappc2lQ9JME7 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Trappc2lQ9JME7 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Trappc2lQ9JME7 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Trappc2lQ9JME7 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Trappc2lQ9JME7 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Trappc2lQ9JME7 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Trappc2lQ9JME7 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Trappc2lQ9JME7 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Trappc2lQ9JME7 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Trappc2lQ9JME7 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Trappc2lQ9JME7 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Trappc2lQ9JME7 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Trappc2lQ9JME7 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trappc2lQ9JME7 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Trappc2lQ9JME7 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Trappc2lQ9JME7 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Trappc2lQ9JME7 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Trappc2lQ9JME7 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Trappc2lQ9JME7 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Trappc2lQ9JME7 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Trappc2lQ9JME7 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Trappc2lQ9JME7 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Trappc2lQ9JME7 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Trappc2lQ9JME7 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Trappc2lQ9JME7 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Trappc2lQ9JME7 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Trappc2lQ9JME7 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Trappc2lQ9JME7 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Trappc2lQ9JME7 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Trappc2lQ9JME7 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Trappc2lQ9JME7 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Trappc2lQ9JME7 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Trappc2lQ9JME7 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Trappc2lQ9JME7 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Trappc2lQ9JME7 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Trappc2lQ9JME7 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Trappc2lQ9JME7 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Trappc2lQ9JME7 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Trappc2lQ9JME7 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Trappc2lQ9JME7 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms