Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMB0

Gkap1, G kinase-anchoring protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gkap1Q9JMB0 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Gkap1Q9JMB0 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Gkap1Q9JMB0 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Gkap1Q9JMB0 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Gkap1Q9JMB0 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Gkap1Q9JMB0 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Gkap1Q9JMB0 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Gkap1Q9JMB0 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Gkap1Q9JMB0 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Gkap1Q9JMB0 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Gkap1Q9JMB0 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Gkap1Q9JMB0 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Gkap1Q9JMB0 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Gkap1Q9JMB0 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Gkap1Q9JMB0 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Gkap1Q9JMB0 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Gkap1Q9JMB0 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Gkap1Q9JMB0 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Gkap1Q9JMB0 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Gkap1Q9JMB0 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Gkap1Q9JMB0 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Gkap1Q9JMB0 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Gkap1Q9JMB0 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Gkap1Q9JMB0 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Gkap1Q9JMB0 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Gkap1Q9JMB0 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Gkap1Q9JMB0 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Gkap1Q9JMB0 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Gkap1Q9JMB0 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Gkap1Q9JMB0 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Gkap1Q9JMB0 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Gkap1Q9JMB0 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Gkap1Q9JMB0 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Gkap1Q9JMB0 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Gkap1Q9JMB0 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Gkap1Q9JMB0 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Gkap1Q9JMB0 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Gkap1Q9JMB0 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Gkap1Q9JMB0 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Gkap1Q9JMB0 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Gkap1Q9JMB0 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Gkap1Q9JMB0 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Gkap1Q9JMB0 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Gkap1Q9JMB0 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Gkap1Q9JMB0 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Gkap1Q9JMB0 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Gkap1Q9JMB0 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Gkap1Q9JMB0 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Gkap1Q9JMB0 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Gkap1Q9JMB0 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Gkap1Q9JMB0 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Gkap1Q9JMB0 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Gkap1Q9JMB0 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Gkap1Q9JMB0 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Gkap1Q9JMB0 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Gkap1Q9JMB0 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Gkap1Q9JMB0 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Gkap1Q9JMB0 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Gkap1Q9JMB0 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Gkap1Q9JMB0 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Gkap1Q9JMB0 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Gkap1Q9JMB0 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Gkap1Q9JMB0 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Gkap1Q9JMB0 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Gkap1Q9JMB0 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Gkap1Q9JMB0 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Gkap1Q9JMB0 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Gkap1Q9JMB0 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Gkap1Q9JMB0 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Gkap1Q9JMB0 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Gkap1Q9JMB0 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Gkap1Q9JMB0 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Gkap1Q9JMB0 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Gkap1Q9JMB0 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Gkap1Q9JMB0 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
Gkap1Q9JMB0 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Gkap1Q9JMB0 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Gkap1Q9JMB0 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Gkap1Q9JMB0 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Gkap1Q9JMB0 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Gkap1Q9JMB0 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Gkap1Q9JMB0 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Gkap1Q9JMB0 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Gkap1Q9JMB0 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Gkap1Q9JMB0 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Gkap1Q9JMB0 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Gkap1Q9JMB0 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Gkap1Q9JMB0 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Gkap1Q9JMB0 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Gkap1Q9JMB0 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Gkap1Q9JMB0 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Gkap1Q9JMB0 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Gkap1Q9JMB0 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Gkap1Q9JMB0 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Gkap1Q9JMB0 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Gkap1Q9JMB0 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Gkap1Q9JMB0 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Gkap1Q9JMB0 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Gkap1Q9JMB0 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Gkap1Q9JMB0 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms