Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLC3

Msrb1, Methionine-R-sulfoxide reductase B1, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msrb1Q9JLC3 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Msrb1Q9JLC3 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Msrb1Q9JLC3 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Msrb1Q9JLC3 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Msrb1Q9JLC3 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Msrb1Q9JLC3 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Msrb1Q9JLC3 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Msrb1Q9JLC3 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Msrb1Q9JLC3 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Msrb1Q9JLC3 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Msrb1Q9JLC3 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Msrb1Q9JLC3 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Msrb1Q9JLC3 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Msrb1Q9JLC3 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Msrb1Q9JLC3 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Msrb1Q9JLC3 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Msrb1Q9JLC3 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Msrb1Q9JLC3 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Msrb1Q9JLC3 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Msrb1Q9JLC3 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Msrb1Q9JLC3 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Msrb1Q9JLC3 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Msrb1Q9JLC3 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Msrb1Q9JLC3 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Msrb1Q9JLC3 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Msrb1Q9JLC3 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Msrb1Q9JLC3 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Msrb1Q9JLC3 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Msrb1Q9JLC3 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Msrb1Q9JLC3 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Msrb1Q9JLC3 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Msrb1Q9JLC3 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Msrb1Q9JLC3 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Msrb1Q9JLC3 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Msrb1Q9JLC3 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Msrb1Q9JLC3 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Msrb1Q9JLC3 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Msrb1Q9JLC3 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Msrb1Q9JLC3 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Msrb1Q9JLC3 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Msrb1Q9JLC3 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Msrb1Q9JLC3 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Msrb1Q9JLC3 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Msrb1Q9JLC3 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Msrb1Q9JLC3 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Msrb1Q9JLC3 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Msrb1Q9JLC3 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Msrb1Q9JLC3 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Msrb1Q9JLC3 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Msrb1Q9JLC3 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Msrb1Q9JLC3 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Msrb1Q9JLC3 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Msrb1Q9JLC3 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Msrb1Q9JLC3 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Msrb1Q9JLC3 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Msrb1Q9JLC3 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Msrb1Q9JLC3 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Msrb1Q9JLC3 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Msrb1Q9JLC3 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Msrb1Q9JLC3 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Msrb1Q9JLC3 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Msrb1Q9JLC3 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Msrb1Q9JLC3 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Msrb1Q9JLC3 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Msrb1Q9JLC3 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Msrb1Q9JLC3 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Msrb1Q9JLC3 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Msrb1Q9JLC3 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Msrb1Q9JLC3 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Msrb1Q9JLC3 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Msrb1Q9JLC3 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Msrb1Q9JLC3 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Msrb1Q9JLC3 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Msrb1Q9JLC3 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Msrb1Q9JLC3 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Msrb1Q9JLC3 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Msrb1Q9JLC3 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Msrb1Q9JLC3 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Msrb1Q9JLC3 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Msrb1Q9JLC3 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Msrb1Q9JLC3 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Msrb1Q9JLC3 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Msrb1Q9JLC3 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Msrb1Q9JLC3 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Msrb1Q9JLC3 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Msrb1Q9JLC3 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Msrb1Q9JLC3 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Msrb1Q9JLC3 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Msrb1Q9JLC3 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Msrb1Q9JLC3 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Msrb1Q9JLC3 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Msrb1Q9JLC3 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Msrb1Q9JLC3 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Msrb1Q9JLC3 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Msrb1Q9JLC3 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Msrb1Q9JLC3 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Msrb1Q9JLC3 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Msrb1Q9JLC3 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Msrb1Q9JLC3 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Msrb1Q9JLC3 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms