Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL89

Ninj2, Ninjurin-2, mousemouse

Predictions only

Length 143 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ninj2Q9JL89 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ninj2Q9JL89 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ninj2Q9JL89 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ninj2Q9JL89 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ninj2Q9JL89 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ninj2Q9JL89 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ninj2Q9JL89 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ninj2Q9JL89 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ninj2Q9JL89 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ninj2Q9JL89 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ninj2Q9JL89 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ninj2Q9JL89 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ninj2Q9JL89 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Ninj2Q9JL89 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ninj2Q9JL89 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ninj2Q9JL89 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ninj2Q9JL89 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ninj2Q9JL89 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ninj2Q9JL89 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ninj2Q9JL89 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ninj2Q9JL89 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ninj2Q9JL89 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ninj2Q9JL89 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ninj2Q9JL89 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ninj2Q9JL89 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ninj2Q9JL89 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ninj2Q9JL89 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ninj2Q9JL89 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ninj2Q9JL89 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ninj2Q9JL89 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ninj2Q9JL89 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ninj2Q9JL89 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ninj2Q9JL89 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ninj2Q9JL89 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ninj2Q9JL89 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ninj2Q9JL89 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Ninj2Q9JL89 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ninj2Q9JL89 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ninj2Q9JL89 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ninj2Q9JL89 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ninj2Q9JL89 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ninj2Q9JL89 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Ninj2Q9JL89 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ninj2Q9JL89 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ninj2Q9JL89 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ninj2Q9JL89 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ninj2Q9JL89 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ninj2Q9JL89 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ninj2Q9JL89 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ninj2Q9JL89 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ninj2Q9JL89 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ninj2Q9JL89 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Ninj2Q9JL89 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ninj2Q9JL89 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ninj2Q9JL89 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ninj2Q9JL89 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ninj2Q9JL89 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ninj2Q9JL89 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ninj2Q9JL89 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ninj2Q9JL89 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ninj2Q9JL89 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ninj2Q9JL89 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ninj2Q9JL89 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ninj2Q9JL89 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ninj2Q9JL89 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ninj2Q9JL89 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ninj2Q9JL89 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ninj2Q9JL89 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ninj2Q9JL89 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ninj2Q9JL89 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Ninj2Q9JL89 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ninj2Q9JL89 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ninj2Q9JL89 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ninj2Q9JL89 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ninj2Q9JL89 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ninj2Q9JL89 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ninj2Q9JL89 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ninj2Q9JL89 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ninj2Q9JL89 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ninj2Q9JL89 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Ninj2Q9JL89 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ninj2Q9JL89 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ninj2Q9JL89 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ninj2Q9JL89 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ninj2Q9JL89 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ninj2Q9JL89 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Ninj2Q9JL89 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ninj2Q9JL89 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ninj2Q9JL89 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ninj2Q9JL89 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ninj2Q9JL89 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ninj2Q9JL89 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ninj2Q9JL89 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ninj2Q9JL89 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ninj2Q9JL89 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ninj2Q9JL89 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ninj2Q9JL89 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ninj2Q9JL89 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Ninj2Q9JL89 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ninj2Q9JL89 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms