Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKS5

Habp4, Intracellular hyaluronan-binding protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Habp4Q9JKS5 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Habp4Q9JKS5 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Habp4Q9JKS5 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Habp4Q9JKS5 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Habp4Q9JKS5 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Habp4Q9JKS5 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Habp4Q9JKS5 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Habp4Q9JKS5 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Habp4Q9JKS5 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Habp4Q9JKS5 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Habp4Q9JKS5 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Habp4Q9JKS5 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Habp4Q9JKS5 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Habp4Q9JKS5 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Habp4Q9JKS5 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Habp4Q9JKS5 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Habp4Q9JKS5 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Habp4Q9JKS5 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Habp4Q9JKS5 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Habp4Q9JKS5 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Habp4Q9JKS5 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Habp4Q9JKS5 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Habp4Q9JKS5 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Habp4Q9JKS5 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Habp4Q9JKS5 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Habp4Q9JKS5 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC27.64■■■□□ 2.01
Habp4Q9JKS5 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Habp4Q9JKS5 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Habp4Q9JKS5 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Habp4Q9JKS5 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Habp4Q9JKS5 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Habp4Q9JKS5 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Habp4Q9JKS5 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Habp4Q9JKS5 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Habp4Q9JKS5 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Habp4Q9JKS5 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Habp4Q9JKS5 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
Habp4Q9JKS5 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Habp4Q9JKS5 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Habp4Q9JKS5 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Habp4Q9JKS5 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Habp4Q9JKS5 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Habp4Q9JKS5 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Habp4Q9JKS5 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Habp4Q9JKS5 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Habp4Q9JKS5 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Habp4Q9JKS5 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Habp4Q9JKS5 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Habp4Q9JKS5 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Habp4Q9JKS5 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Habp4Q9JKS5 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Habp4Q9JKS5 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Habp4Q9JKS5 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Habp4Q9JKS5 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Habp4Q9JKS5 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Habp4Q9JKS5 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Habp4Q9JKS5 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Habp4Q9JKS5 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Habp4Q9JKS5 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Habp4Q9JKS5 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Habp4Q9JKS5 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Habp4Q9JKS5 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Habp4Q9JKS5 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Habp4Q9JKS5 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Habp4Q9JKS5 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Habp4Q9JKS5 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Habp4Q9JKS5 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Habp4Q9JKS5 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Habp4Q9JKS5 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Habp4Q9JKS5 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Habp4Q9JKS5 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Habp4Q9JKS5 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Habp4Q9JKS5 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Habp4Q9JKS5 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Habp4Q9JKS5 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Habp4Q9JKS5 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
Habp4Q9JKS5 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Habp4Q9JKS5 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Habp4Q9JKS5 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Habp4Q9JKS5 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Habp4Q9JKS5 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Habp4Q9JKS5 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Habp4Q9JKS5 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Habp4Q9JKS5 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Habp4Q9JKS5 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Habp4Q9JKS5 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Habp4Q9JKS5 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Habp4Q9JKS5 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Habp4Q9JKS5 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Habp4Q9JKS5 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Habp4Q9JKS5 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Habp4Q9JKS5 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Habp4Q9JKS5 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Habp4Q9JKS5 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
Habp4Q9JKS5 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Habp4Q9JKS5 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Habp4Q9JKS5 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Habp4Q9JKS5 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Habp4Q9JKS5 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Habp4Q9JKS5 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms