Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJZ8

Cnga3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnga3Q9JJZ8 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Cnga3Q9JJZ8 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC28.7■■■□□ 2.19
Cnga3Q9JJZ8 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Cnga3Q9JJZ8 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Cnga3Q9JJZ8 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Cnga3Q9JJZ8 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Cnga3Q9JJZ8 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Cnga3Q9JJZ8 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Cnga3Q9JJZ8 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Cnga3Q9JJZ8 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Cnga3Q9JJZ8 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Cnga3Q9JJZ8 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Cnga3Q9JJZ8 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Cnga3Q9JJZ8 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Cnga3Q9JJZ8 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Cnga3Q9JJZ8 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Cnga3Q9JJZ8 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
Cnga3Q9JJZ8 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Cnga3Q9JJZ8 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Cnga3Q9JJZ8 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
Cnga3Q9JJZ8 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Cnga3Q9JJZ8 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Cnga3Q9JJZ8 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Cnga3Q9JJZ8 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Cnga3Q9JJZ8 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Cnga3Q9JJZ8 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Cnga3Q9JJZ8 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Cnga3Q9JJZ8 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Cnga3Q9JJZ8 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Cnga3Q9JJZ8 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Cnga3Q9JJZ8 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Cnga3Q9JJZ8 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Cnga3Q9JJZ8 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Cnga3Q9JJZ8 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Cnga3Q9JJZ8 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Cnga3Q9JJZ8 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Cnga3Q9JJZ8 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Cnga3Q9JJZ8 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Cnga3Q9JJZ8 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Cnga3Q9JJZ8 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Cnga3Q9JJZ8 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Cnga3Q9JJZ8 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Cnga3Q9JJZ8 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Cnga3Q9JJZ8 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Cnga3Q9JJZ8 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Cnga3Q9JJZ8 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Cnga3Q9JJZ8 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Cnga3Q9JJZ8 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Cnga3Q9JJZ8 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Cnga3Q9JJZ8 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Cnga3Q9JJZ8 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
Cnga3Q9JJZ8 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Cnga3Q9JJZ8 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Cnga3Q9JJZ8 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Cnga3Q9JJZ8 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Cnga3Q9JJZ8 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Cnga3Q9JJZ8 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Cnga3Q9JJZ8 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Cnga3Q9JJZ8 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Cnga3Q9JJZ8 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Cnga3Q9JJZ8 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Cnga3Q9JJZ8 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Cnga3Q9JJZ8 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Cnga3Q9JJZ8 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Cnga3Q9JJZ8 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Cnga3Q9JJZ8 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Cnga3Q9JJZ8 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Cnga3Q9JJZ8 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Cnga3Q9JJZ8 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Cnga3Q9JJZ8 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Cnga3Q9JJZ8 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Cnga3Q9JJZ8 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Cnga3Q9JJZ8 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Cnga3Q9JJZ8 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Cnga3Q9JJZ8 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Cnga3Q9JJZ8 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Cnga3Q9JJZ8 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Cnga3Q9JJZ8 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
Cnga3Q9JJZ8 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Cnga3Q9JJZ8 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Cnga3Q9JJZ8 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Cnga3Q9JJZ8 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Cnga3Q9JJZ8 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Cnga3Q9JJZ8 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Cnga3Q9JJZ8 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Cnga3Q9JJZ8 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Cnga3Q9JJZ8 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Cnga3Q9JJZ8 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Cnga3Q9JJZ8 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Cnga3Q9JJZ8 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
Cnga3Q9JJZ8 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Cnga3Q9JJZ8 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Cnga3Q9JJZ8 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Cnga3Q9JJZ8 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Cnga3Q9JJZ8 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Cnga3Q9JJZ8 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Cnga3Q9JJZ8 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Cnga3Q9JJZ8 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Cnga3Q9JJZ8 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Cnga3Q9JJZ8 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
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