Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJT0

Rcl1, RNA 3'-terminal phosphate cyclase-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 373 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcl1Q9JJT0 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rcl1Q9JJT0 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Rcl1Q9JJT0 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rcl1Q9JJT0 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rcl1Q9JJT0 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rcl1Q9JJT0 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rcl1Q9JJT0 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rcl1Q9JJT0 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rcl1Q9JJT0 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rcl1Q9JJT0 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rcl1Q9JJT0 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rcl1Q9JJT0 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Rcl1Q9JJT0 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rcl1Q9JJT0 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rcl1Q9JJT0 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rcl1Q9JJT0 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rcl1Q9JJT0 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rcl1Q9JJT0 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rcl1Q9JJT0 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rcl1Q9JJT0 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rcl1Q9JJT0 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Rcl1Q9JJT0 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rcl1Q9JJT0 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Rcl1Q9JJT0 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rcl1Q9JJT0 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rcl1Q9JJT0 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rcl1Q9JJT0 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rcl1Q9JJT0 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Rcl1Q9JJT0 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rcl1Q9JJT0 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rcl1Q9JJT0 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rcl1Q9JJT0 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rcl1Q9JJT0 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Rcl1Q9JJT0 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rcl1Q9JJT0 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rcl1Q9JJT0 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rcl1Q9JJT0 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rcl1Q9JJT0 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rcl1Q9JJT0 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rcl1Q9JJT0 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rcl1Q9JJT0 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rcl1Q9JJT0 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rcl1Q9JJT0 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rcl1Q9JJT0 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rcl1Q9JJT0 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rcl1Q9JJT0 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rcl1Q9JJT0 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rcl1Q9JJT0 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rcl1Q9JJT0 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rcl1Q9JJT0 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rcl1Q9JJT0 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rcl1Q9JJT0 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rcl1Q9JJT0 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rcl1Q9JJT0 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rcl1Q9JJT0 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rcl1Q9JJT0 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rcl1Q9JJT0 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rcl1Q9JJT0 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Rcl1Q9JJT0 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Rcl1Q9JJT0 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rcl1Q9JJT0 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rcl1Q9JJT0 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rcl1Q9JJT0 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Rcl1Q9JJT0 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rcl1Q9JJT0 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Rcl1Q9JJT0 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rcl1Q9JJT0 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Rcl1Q9JJT0 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rcl1Q9JJT0 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rcl1Q9JJT0 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rcl1Q9JJT0 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rcl1Q9JJT0 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Rcl1Q9JJT0 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rcl1Q9JJT0 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rcl1Q9JJT0 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rcl1Q9JJT0 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rcl1Q9JJT0 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rcl1Q9JJT0 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rcl1Q9JJT0 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rcl1Q9JJT0 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rcl1Q9JJT0 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rcl1Q9JJT0 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rcl1Q9JJT0 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rcl1Q9JJT0 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Rcl1Q9JJT0 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rcl1Q9JJT0 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rcl1Q9JJT0 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rcl1Q9JJT0 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rcl1Q9JJT0 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Rcl1Q9JJT0 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rcl1Q9JJT0 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rcl1Q9JJT0 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rcl1Q9JJT0 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rcl1Q9JJT0 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rcl1Q9JJT0 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rcl1Q9JJT0 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rcl1Q9JJT0 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rcl1Q9JJT0 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rcl1Q9JJT0 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rcl1Q9JJT0 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
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