Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJN2

Zfhx4, Zinc finger homeobox protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 3,550 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfhx4Q9JJN2 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Zfhx4Q9JJN2 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Zfhx4Q9JJN2 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Zfhx4Q9JJN2 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Zfhx4Q9JJN2 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Zfhx4Q9JJN2 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Zfhx4Q9JJN2 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Zfhx4Q9JJN2 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Zfhx4Q9JJN2 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Zfhx4Q9JJN2 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Zfhx4Q9JJN2 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Zfhx4Q9JJN2 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Zfhx4Q9JJN2 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Zfhx4Q9JJN2 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Zfhx4Q9JJN2 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Zfhx4Q9JJN2 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Zfhx4Q9JJN2 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Zfhx4Q9JJN2 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Zfhx4Q9JJN2 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Zfhx4Q9JJN2 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Zfhx4Q9JJN2 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Zfhx4Q9JJN2 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Zfhx4Q9JJN2 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Zfhx4Q9JJN2 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Zfhx4Q9JJN2 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Zfhx4Q9JJN2 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Zfhx4Q9JJN2 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Zfhx4Q9JJN2 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Zfhx4Q9JJN2 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Zfhx4Q9JJN2 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Zfhx4Q9JJN2 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Zfhx4Q9JJN2 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Zfhx4Q9JJN2 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Zfhx4Q9JJN2 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Zfhx4Q9JJN2 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Zfhx4Q9JJN2 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Zfhx4Q9JJN2 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Zfhx4Q9JJN2 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Zfhx4Q9JJN2 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Zfhx4Q9JJN2 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Zfhx4Q9JJN2 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Zfhx4Q9JJN2 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Zfhx4Q9JJN2 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Zfhx4Q9JJN2 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Zfhx4Q9JJN2 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Zfhx4Q9JJN2 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Zfhx4Q9JJN2 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Zfhx4Q9JJN2 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
Zfhx4Q9JJN2 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Zfhx4Q9JJN2 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Zfhx4Q9JJN2 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Zfhx4Q9JJN2 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Zfhx4Q9JJN2 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Zfhx4Q9JJN2 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Zfhx4Q9JJN2 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Zfhx4Q9JJN2 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Zfhx4Q9JJN2 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Zfhx4Q9JJN2 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Zfhx4Q9JJN2 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Zfhx4Q9JJN2 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Zfhx4Q9JJN2 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Zfhx4Q9JJN2 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Zfhx4Q9JJN2 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Zfhx4Q9JJN2 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Zfhx4Q9JJN2 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Zfhx4Q9JJN2 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Zfhx4Q9JJN2 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Zfhx4Q9JJN2 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Zfhx4Q9JJN2 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Zfhx4Q9JJN2 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Zfhx4Q9JJN2 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Zfhx4Q9JJN2 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Zfhx4Q9JJN2 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Zfhx4Q9JJN2 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Zfhx4Q9JJN2 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Zfhx4Q9JJN2 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Zfhx4Q9JJN2 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Zfhx4Q9JJN2 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Zfhx4Q9JJN2 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Zfhx4Q9JJN2 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Zfhx4Q9JJN2 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Zfhx4Q9JJN2 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Zfhx4Q9JJN2 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Zfhx4Q9JJN2 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Zfhx4Q9JJN2 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Zfhx4Q9JJN2 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Zfhx4Q9JJN2 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Zfhx4Q9JJN2 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Zfhx4Q9JJN2 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Zfhx4Q9JJN2 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Zfhx4Q9JJN2 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Zfhx4Q9JJN2 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Zfhx4Q9JJN2 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Zfhx4Q9JJN2 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Zfhx4Q9JJN2 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Zfhx4Q9JJN2 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Zfhx4Q9JJN2 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Zfhx4Q9JJN2 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Zfhx4Q9JJN2 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Zfhx4Q9JJN2 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms