Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIS8

Slc12a4, Solute carrier family 12 member 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,085 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc12a4Q9JIS8 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Slc12a4Q9JIS8 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Slc12a4Q9JIS8 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Slc12a4Q9JIS8 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Slc12a4Q9JIS8 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Slc12a4Q9JIS8 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Slc12a4Q9JIS8 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Slc12a4Q9JIS8 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Slc12a4Q9JIS8 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Slc12a4Q9JIS8 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Slc12a4Q9JIS8 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Slc12a4Q9JIS8 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Slc12a4Q9JIS8 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Slc12a4Q9JIS8 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Slc12a4Q9JIS8 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Slc12a4Q9JIS8 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Slc12a4Q9JIS8 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Slc12a4Q9JIS8 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Slc12a4Q9JIS8 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Slc12a4Q9JIS8 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Slc12a4Q9JIS8 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Slc12a4Q9JIS8 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Slc12a4Q9JIS8 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Slc12a4Q9JIS8 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Slc12a4Q9JIS8 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Slc12a4Q9JIS8 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Slc12a4Q9JIS8 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Slc12a4Q9JIS8 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Slc12a4Q9JIS8 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Slc12a4Q9JIS8 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Slc12a4Q9JIS8 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Slc12a4Q9JIS8 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Slc12a4Q9JIS8 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Slc12a4Q9JIS8 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Slc12a4Q9JIS8 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Slc12a4Q9JIS8 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Slc12a4Q9JIS8 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Slc12a4Q9JIS8 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Slc12a4Q9JIS8 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Slc12a4Q9JIS8 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Slc12a4Q9JIS8 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Slc12a4Q9JIS8 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Slc12a4Q9JIS8 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Slc12a4Q9JIS8 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Slc12a4Q9JIS8 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Slc12a4Q9JIS8 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Slc12a4Q9JIS8 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Slc12a4Q9JIS8 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Slc12a4Q9JIS8 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Slc12a4Q9JIS8 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Slc12a4Q9JIS8 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Slc12a4Q9JIS8 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Slc12a4Q9JIS8 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Slc12a4Q9JIS8 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Slc12a4Q9JIS8 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Slc12a4Q9JIS8 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Slc12a4Q9JIS8 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Slc12a4Q9JIS8 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Slc12a4Q9JIS8 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Slc12a4Q9JIS8 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Slc12a4Q9JIS8 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Slc12a4Q9JIS8 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Slc12a4Q9JIS8 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Slc12a4Q9JIS8 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Slc12a4Q9JIS8 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Slc12a4Q9JIS8 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Slc12a4Q9JIS8 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Slc12a4Q9JIS8 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Slc12a4Q9JIS8 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Slc12a4Q9JIS8 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
Slc12a4Q9JIS8 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Slc12a4Q9JIS8 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Slc12a4Q9JIS8 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Slc12a4Q9JIS8 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Slc12a4Q9JIS8 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Slc12a4Q9JIS8 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Slc12a4Q9JIS8 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Slc12a4Q9JIS8 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Slc12a4Q9JIS8 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Slc12a4Q9JIS8 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Slc12a4Q9JIS8 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Slc12a4Q9JIS8 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Slc12a4Q9JIS8 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Slc12a4Q9JIS8 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Slc12a4Q9JIS8 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Slc12a4Q9JIS8 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Slc12a4Q9JIS8 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Slc12a4Q9JIS8 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Slc12a4Q9JIS8 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Slc12a4Q9JIS8 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Slc12a4Q9JIS8 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Slc12a4Q9JIS8 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Slc12a4Q9JIS8 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Slc12a4Q9JIS8 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Slc12a4Q9JIS8 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Slc12a4Q9JIS8 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Slc12a4Q9JIS8 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Slc12a4Q9JIS8 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Slc12a4Q9JIS8 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Slc12a4Q9JIS8 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 137 ms