Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIG7

Ccdc22, Coiled-coil domain-containing protein 22, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc22Q9JIG7 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ccdc22Q9JIG7 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ccdc22Q9JIG7 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ccdc22Q9JIG7 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ccdc22Q9JIG7 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ccdc22Q9JIG7 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ccdc22Q9JIG7 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ccdc22Q9JIG7 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ccdc22Q9JIG7 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ccdc22Q9JIG7 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ccdc22Q9JIG7 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccdc22Q9JIG7 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ccdc22Q9JIG7 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccdc22Q9JIG7 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ccdc22Q9JIG7 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccdc22Q9JIG7 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccdc22Q9JIG7 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Ccdc22Q9JIG7 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ccdc22Q9JIG7 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ccdc22Q9JIG7 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ccdc22Q9JIG7 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ccdc22Q9JIG7 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccdc22Q9JIG7 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccdc22Q9JIG7 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccdc22Q9JIG7 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccdc22Q9JIG7 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccdc22Q9JIG7 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ccdc22Q9JIG7 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ccdc22Q9JIG7 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ccdc22Q9JIG7 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccdc22Q9JIG7 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccdc22Q9JIG7 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccdc22Q9JIG7 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ccdc22Q9JIG7 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccdc22Q9JIG7 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccdc22Q9JIG7 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccdc22Q9JIG7 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccdc22Q9JIG7 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccdc22Q9JIG7 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccdc22Q9JIG7 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccdc22Q9JIG7 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccdc22Q9JIG7 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccdc22Q9JIG7 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccdc22Q9JIG7 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccdc22Q9JIG7 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccdc22Q9JIG7 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccdc22Q9JIG7 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccdc22Q9JIG7 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Ccdc22Q9JIG7 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Ccdc22Q9JIG7 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ccdc22Q9JIG7 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ccdc22Q9JIG7 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ccdc22Q9JIG7 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccdc22Q9JIG7 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccdc22Q9JIG7 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccdc22Q9JIG7 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccdc22Q9JIG7 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccdc22Q9JIG7 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccdc22Q9JIG7 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccdc22Q9JIG7 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccdc22Q9JIG7 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccdc22Q9JIG7 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccdc22Q9JIG7 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccdc22Q9JIG7 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccdc22Q9JIG7 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccdc22Q9JIG7 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccdc22Q9JIG7 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccdc22Q9JIG7 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ccdc22Q9JIG7 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccdc22Q9JIG7 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccdc22Q9JIG7 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccdc22Q9JIG7 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccdc22Q9JIG7 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccdc22Q9JIG7 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccdc22Q9JIG7 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccdc22Q9JIG7 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccdc22Q9JIG7 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccdc22Q9JIG7 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccdc22Q9JIG7 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccdc22Q9JIG7 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccdc22Q9JIG7 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccdc22Q9JIG7 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc22Q9JIG7 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc22Q9JIG7 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc22Q9JIG7 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc22Q9JIG7 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc22Q9JIG7 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccdc22Q9JIG7 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccdc22Q9JIG7 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccdc22Q9JIG7 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc22Q9JIG7 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc22Q9JIG7 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc22Q9JIG7 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc22Q9JIG7 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc22Q9JIG7 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc22Q9JIG7 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc22Q9JIG7 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc22Q9JIG7 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc22Q9JIG7 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccdc22Q9JIG7 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms