Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESW8

Pgpep1, Pyroglutamyl-peptidase 1, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pgpep1Q9ESW8 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pgpep1Q9ESW8 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pgpep1Q9ESW8 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pgpep1Q9ESW8 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pgpep1Q9ESW8 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pgpep1Q9ESW8 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pgpep1Q9ESW8 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pgpep1Q9ESW8 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pgpep1Q9ESW8 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pgpep1Q9ESW8 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pgpep1Q9ESW8 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pgpep1Q9ESW8 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pgpep1Q9ESW8 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pgpep1Q9ESW8 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pgpep1Q9ESW8 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Pgpep1Q9ESW8 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pgpep1Q9ESW8 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pgpep1Q9ESW8 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pgpep1Q9ESW8 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pgpep1Q9ESW8 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pgpep1Q9ESW8 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pgpep1Q9ESW8 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pgpep1Q9ESW8 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Pgpep1Q9ESW8 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pgpep1Q9ESW8 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pgpep1Q9ESW8 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pgpep1Q9ESW8 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pgpep1Q9ESW8 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pgpep1Q9ESW8 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pgpep1Q9ESW8 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pgpep1Q9ESW8 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pgpep1Q9ESW8 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pgpep1Q9ESW8 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pgpep1Q9ESW8 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pgpep1Q9ESW8 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pgpep1Q9ESW8 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pgpep1Q9ESW8 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Pgpep1Q9ESW8 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pgpep1Q9ESW8 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pgpep1Q9ESW8 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pgpep1Q9ESW8 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pgpep1Q9ESW8 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pgpep1Q9ESW8 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pgpep1Q9ESW8 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pgpep1Q9ESW8 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pgpep1Q9ESW8 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Pgpep1Q9ESW8 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pgpep1Q9ESW8 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pgpep1Q9ESW8 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pgpep1Q9ESW8 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pgpep1Q9ESW8 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pgpep1Q9ESW8 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pgpep1Q9ESW8 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Pgpep1Q9ESW8 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pgpep1Q9ESW8 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pgpep1Q9ESW8 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pgpep1Q9ESW8 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pgpep1Q9ESW8 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pgpep1Q9ESW8 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pgpep1Q9ESW8 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pgpep1Q9ESW8 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pgpep1Q9ESW8 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pgpep1Q9ESW8 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pgpep1Q9ESW8 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Pgpep1Q9ESW8 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pgpep1Q9ESW8 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pgpep1Q9ESW8 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pgpep1Q9ESW8 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pgpep1Q9ESW8 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pgpep1Q9ESW8 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pgpep1Q9ESW8 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pgpep1Q9ESW8 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pgpep1Q9ESW8 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pgpep1Q9ESW8 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pgpep1Q9ESW8 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pgpep1Q9ESW8 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pgpep1Q9ESW8 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pgpep1Q9ESW8 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pgpep1Q9ESW8 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pgpep1Q9ESW8 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pgpep1Q9ESW8 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pgpep1Q9ESW8 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Pgpep1Q9ESW8 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pgpep1Q9ESW8 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pgpep1Q9ESW8 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pgpep1Q9ESW8 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pgpep1Q9ESW8 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pgpep1Q9ESW8 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pgpep1Q9ESW8 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pgpep1Q9ESW8 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pgpep1Q9ESW8 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pgpep1Q9ESW8 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pgpep1Q9ESW8 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pgpep1Q9ESW8 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pgpep1Q9ESW8 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pgpep1Q9ESW8 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pgpep1Q9ESW8 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pgpep1Q9ESW8 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pgpep1Q9ESW8 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pgpep1Q9ESW8 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
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