Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES64

Ush1c, Harmonin, mousemouse

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ush1cQ9ES64 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Ush1cQ9ES64 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
Ush1cQ9ES64 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Ush1cQ9ES64 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Ush1cQ9ES64 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Ush1cQ9ES64 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Ush1cQ9ES64 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Ush1cQ9ES64 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Ush1cQ9ES64 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Ush1cQ9ES64 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Ush1cQ9ES64 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Ush1cQ9ES64 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Ush1cQ9ES64 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Ush1cQ9ES64 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Ush1cQ9ES64 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Ush1cQ9ES64 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Ush1cQ9ES64 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
Ush1cQ9ES64 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Ush1cQ9ES64 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Ush1cQ9ES64 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Ush1cQ9ES64 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Ush1cQ9ES64 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Ush1cQ9ES64 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Ush1cQ9ES64 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Ush1cQ9ES64 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Ush1cQ9ES64 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Ush1cQ9ES64 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Ush1cQ9ES64 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Ush1cQ9ES64 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Ush1cQ9ES64 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Ush1cQ9ES64 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Ush1cQ9ES64 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Ush1cQ9ES64 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Ush1cQ9ES64 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Ush1cQ9ES64 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
Ush1cQ9ES64 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Ush1cQ9ES64 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Ush1cQ9ES64 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
Ush1cQ9ES64 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Ush1cQ9ES64 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Ush1cQ9ES64 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Ush1cQ9ES64 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Ush1cQ9ES64 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Ush1cQ9ES64 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Ush1cQ9ES64 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Ush1cQ9ES64 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
Ush1cQ9ES64 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Ush1cQ9ES64 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Ush1cQ9ES64 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Ush1cQ9ES64 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Ush1cQ9ES64 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Ush1cQ9ES64 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Ush1cQ9ES64 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Ush1cQ9ES64 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Ush1cQ9ES64 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Ush1cQ9ES64 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Ush1cQ9ES64 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Ush1cQ9ES64 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Ush1cQ9ES64 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Ush1cQ9ES64 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Ush1cQ9ES64 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
Ush1cQ9ES64 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Ush1cQ9ES64 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Ush1cQ9ES64 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Ush1cQ9ES64 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Ush1cQ9ES64 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Ush1cQ9ES64 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Ush1cQ9ES64 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Ush1cQ9ES64 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Ush1cQ9ES64 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Ush1cQ9ES64 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Ush1cQ9ES64 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Ush1cQ9ES64 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Ush1cQ9ES64 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Ush1cQ9ES64 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Ush1cQ9ES64 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Ush1cQ9ES64 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
Ush1cQ9ES64 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Ush1cQ9ES64 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Ush1cQ9ES64 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Ush1cQ9ES64 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Ush1cQ9ES64 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Ush1cQ9ES64 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Ush1cQ9ES64 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Ush1cQ9ES64 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Ush1cQ9ES64 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Ush1cQ9ES64 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Ush1cQ9ES64 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Ush1cQ9ES64 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Ush1cQ9ES64 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Ush1cQ9ES64 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Ush1cQ9ES64 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Ush1cQ9ES64 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Ush1cQ9ES64 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Ush1cQ9ES64 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Ush1cQ9ES64 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
Ush1cQ9ES64 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Ush1cQ9ES64 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Ush1cQ9ES64 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Ush1cQ9ES64 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms