Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERZ3

Chrm3, Muscarinic acetylcholine receptor M3, mousemouse

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrm3Q9ERZ3 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Chrm3Q9ERZ3 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Chrm3Q9ERZ3 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Chrm3Q9ERZ3 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Chrm3Q9ERZ3 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Chrm3Q9ERZ3 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Chrm3Q9ERZ3 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Chrm3Q9ERZ3 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Chrm3Q9ERZ3 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Chrm3Q9ERZ3 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Chrm3Q9ERZ3 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Chrm3Q9ERZ3 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Chrm3Q9ERZ3 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Chrm3Q9ERZ3 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Chrm3Q9ERZ3 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Chrm3Q9ERZ3 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Chrm3Q9ERZ3 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Chrm3Q9ERZ3 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Chrm3Q9ERZ3 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Chrm3Q9ERZ3 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Chrm3Q9ERZ3 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Chrm3Q9ERZ3 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Chrm3Q9ERZ3 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Chrm3Q9ERZ3 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Chrm3Q9ERZ3 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Chrm3Q9ERZ3 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Chrm3Q9ERZ3 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Chrm3Q9ERZ3 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Chrm3Q9ERZ3 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Chrm3Q9ERZ3 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Chrm3Q9ERZ3 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Chrm3Q9ERZ3 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Chrm3Q9ERZ3 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Chrm3Q9ERZ3 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Chrm3Q9ERZ3 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Chrm3Q9ERZ3 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Chrm3Q9ERZ3 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Chrm3Q9ERZ3 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Chrm3Q9ERZ3 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Chrm3Q9ERZ3 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Chrm3Q9ERZ3 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Chrm3Q9ERZ3 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Chrm3Q9ERZ3 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Chrm3Q9ERZ3 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Chrm3Q9ERZ3 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Chrm3Q9ERZ3 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Chrm3Q9ERZ3 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Chrm3Q9ERZ3 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Chrm3Q9ERZ3 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Chrm3Q9ERZ3 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Chrm3Q9ERZ3 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Chrm3Q9ERZ3 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Chrm3Q9ERZ3 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Chrm3Q9ERZ3 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Chrm3Q9ERZ3 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Chrm3Q9ERZ3 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Chrm3Q9ERZ3 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Chrm3Q9ERZ3 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Chrm3Q9ERZ3 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Chrm3Q9ERZ3 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Chrm3Q9ERZ3 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Chrm3Q9ERZ3 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Chrm3Q9ERZ3 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Chrm3Q9ERZ3 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Chrm3Q9ERZ3 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Chrm3Q9ERZ3 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Chrm3Q9ERZ3 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Chrm3Q9ERZ3 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Chrm3Q9ERZ3 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Chrm3Q9ERZ3 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Chrm3Q9ERZ3 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Chrm3Q9ERZ3 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Chrm3Q9ERZ3 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Chrm3Q9ERZ3 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Chrm3Q9ERZ3 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Chrm3Q9ERZ3 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Chrm3Q9ERZ3 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Chrm3Q9ERZ3 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Chrm3Q9ERZ3 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Chrm3Q9ERZ3 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Chrm3Q9ERZ3 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Chrm3Q9ERZ3 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Chrm3Q9ERZ3 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Chrm3Q9ERZ3 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Chrm3Q9ERZ3 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Chrm3Q9ERZ3 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Chrm3Q9ERZ3 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Chrm3Q9ERZ3 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Chrm3Q9ERZ3 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Chrm3Q9ERZ3 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Chrm3Q9ERZ3 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Chrm3Q9ERZ3 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Chrm3Q9ERZ3 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Chrm3Q9ERZ3 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Chrm3Q9ERZ3 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Chrm3Q9ERZ3 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Chrm3Q9ERZ3 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Chrm3Q9ERZ3 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Chrm3Q9ERZ3 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Chrm3Q9ERZ3 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms