Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERE2

Krt81, Keratin, type II cuticular Hb1, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt81Q9ERE2 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Krt81Q9ERE2 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Krt81Q9ERE2 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Krt81Q9ERE2 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Krt81Q9ERE2 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Krt81Q9ERE2 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Krt81Q9ERE2 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Krt81Q9ERE2 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Krt81Q9ERE2 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Krt81Q9ERE2 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Krt81Q9ERE2 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Krt81Q9ERE2 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Krt81Q9ERE2 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Krt81Q9ERE2 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Krt81Q9ERE2 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Krt81Q9ERE2 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Krt81Q9ERE2 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Krt81Q9ERE2 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Krt81Q9ERE2 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Krt81Q9ERE2 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Krt81Q9ERE2 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Krt81Q9ERE2 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Krt81Q9ERE2 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Krt81Q9ERE2 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Krt81Q9ERE2 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Krt81Q9ERE2 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Krt81Q9ERE2 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Krt81Q9ERE2 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Krt81Q9ERE2 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Krt81Q9ERE2 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
Krt81Q9ERE2 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Krt81Q9ERE2 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Krt81Q9ERE2 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Krt81Q9ERE2 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Krt81Q9ERE2 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Krt81Q9ERE2 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Krt81Q9ERE2 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Krt81Q9ERE2 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Krt81Q9ERE2 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Krt81Q9ERE2 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Krt81Q9ERE2 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Krt81Q9ERE2 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Krt81Q9ERE2 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Krt81Q9ERE2 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Krt81Q9ERE2 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Krt81Q9ERE2 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Krt81Q9ERE2 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Krt81Q9ERE2 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Krt81Q9ERE2 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Krt81Q9ERE2 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Krt81Q9ERE2 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Krt81Q9ERE2 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Krt81Q9ERE2 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Krt81Q9ERE2 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Krt81Q9ERE2 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Krt81Q9ERE2 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Krt81Q9ERE2 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Krt81Q9ERE2 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Krt81Q9ERE2 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Krt81Q9ERE2 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Krt81Q9ERE2 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Krt81Q9ERE2 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Krt81Q9ERE2 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Krt81Q9ERE2 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Krt81Q9ERE2 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Krt81Q9ERE2 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Krt81Q9ERE2 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Krt81Q9ERE2 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Krt81Q9ERE2 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Krt81Q9ERE2 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Krt81Q9ERE2 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Krt81Q9ERE2 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Krt81Q9ERE2 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Krt81Q9ERE2 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Krt81Q9ERE2 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Krt81Q9ERE2 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Krt81Q9ERE2 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Krt81Q9ERE2 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Krt81Q9ERE2 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Krt81Q9ERE2 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Krt81Q9ERE2 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Krt81Q9ERE2 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Krt81Q9ERE2 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Krt81Q9ERE2 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Krt81Q9ERE2 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Krt81Q9ERE2 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Krt81Q9ERE2 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Krt81Q9ERE2 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Krt81Q9ERE2 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Krt81Q9ERE2 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Krt81Q9ERE2 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Krt81Q9ERE2 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Krt81Q9ERE2 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Krt81Q9ERE2 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Krt81Q9ERE2 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Krt81Q9ERE2 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Krt81Q9ERE2 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Krt81Q9ERE2 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Krt81Q9ERE2 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Krt81Q9ERE2 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms