Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER00

Stx12, Syntaxin-12, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx12Q9ER00 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Stx12Q9ER00 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Stx12Q9ER00 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Stx12Q9ER00 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Stx12Q9ER00 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Stx12Q9ER00 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Stx12Q9ER00 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Stx12Q9ER00 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Stx12Q9ER00 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Stx12Q9ER00 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Stx12Q9ER00 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Stx12Q9ER00 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Stx12Q9ER00 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Stx12Q9ER00 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Stx12Q9ER00 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Stx12Q9ER00 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Stx12Q9ER00 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Stx12Q9ER00 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Stx12Q9ER00 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Stx12Q9ER00 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Stx12Q9ER00 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Stx12Q9ER00 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Stx12Q9ER00 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Stx12Q9ER00 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Stx12Q9ER00 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Stx12Q9ER00 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Stx12Q9ER00 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Stx12Q9ER00 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Stx12Q9ER00 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Stx12Q9ER00 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Stx12Q9ER00 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Stx12Q9ER00 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Stx12Q9ER00 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Stx12Q9ER00 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Stx12Q9ER00 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Stx12Q9ER00 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Stx12Q9ER00 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Stx12Q9ER00 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Stx12Q9ER00 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Stx12Q9ER00 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Stx12Q9ER00 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Stx12Q9ER00 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Stx12Q9ER00 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Stx12Q9ER00 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Stx12Q9ER00 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Stx12Q9ER00 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Stx12Q9ER00 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Stx12Q9ER00 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Stx12Q9ER00 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Stx12Q9ER00 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Stx12Q9ER00 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Stx12Q9ER00 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Stx12Q9ER00 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Stx12Q9ER00 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Stx12Q9ER00 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Stx12Q9ER00 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Stx12Q9ER00 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Stx12Q9ER00 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Stx12Q9ER00 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Stx12Q9ER00 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Stx12Q9ER00 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Stx12Q9ER00 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Stx12Q9ER00 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Stx12Q9ER00 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Stx12Q9ER00 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Stx12Q9ER00 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Stx12Q9ER00 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Stx12Q9ER00 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
Stx12Q9ER00 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Stx12Q9ER00 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Stx12Q9ER00 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Stx12Q9ER00 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Stx12Q9ER00 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Stx12Q9ER00 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Stx12Q9ER00 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Stx12Q9ER00 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Stx12Q9ER00 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Stx12Q9ER00 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Stx12Q9ER00 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Stx12Q9ER00 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Stx12Q9ER00 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Stx12Q9ER00 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Stx12Q9ER00 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Stx12Q9ER00 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Stx12Q9ER00 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Stx12Q9ER00 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Stx12Q9ER00 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Stx12Q9ER00 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Stx12Q9ER00 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Stx12Q9ER00 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Stx12Q9ER00 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Stx12Q9ER00 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Stx12Q9ER00 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Stx12Q9ER00 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Stx12Q9ER00 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Stx12Q9ER00 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Stx12Q9ER00 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Stx12Q9ER00 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Stx12Q9ER00 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Stx12Q9ER00 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.2 ms