Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQS3

Mycbp, c-Myc-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 103 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MycbpQ9EQS3 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MycbpQ9EQS3 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
MycbpQ9EQS3 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
MycbpQ9EQS3 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
MycbpQ9EQS3 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
MycbpQ9EQS3 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
MycbpQ9EQS3 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MycbpQ9EQS3 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MycbpQ9EQS3 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
MycbpQ9EQS3 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
MycbpQ9EQS3 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
MycbpQ9EQS3 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
MycbpQ9EQS3 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
MycbpQ9EQS3 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MycbpQ9EQS3 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
MycbpQ9EQS3 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MycbpQ9EQS3 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MycbpQ9EQS3 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MycbpQ9EQS3 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
MycbpQ9EQS3 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
MycbpQ9EQS3 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MycbpQ9EQS3 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
MycbpQ9EQS3 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MycbpQ9EQS3 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MycbpQ9EQS3 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MycbpQ9EQS3 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MycbpQ9EQS3 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MycbpQ9EQS3 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MycbpQ9EQS3 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MycbpQ9EQS3 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
MycbpQ9EQS3 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
MycbpQ9EQS3 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MycbpQ9EQS3 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MycbpQ9EQS3 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MycbpQ9EQS3 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MycbpQ9EQS3 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MycbpQ9EQS3 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MycbpQ9EQS3 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
MycbpQ9EQS3 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MycbpQ9EQS3 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
MycbpQ9EQS3 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MycbpQ9EQS3 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MycbpQ9EQS3 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MycbpQ9EQS3 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MycbpQ9EQS3 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MycbpQ9EQS3 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
MycbpQ9EQS3 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MycbpQ9EQS3 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MycbpQ9EQS3 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MycbpQ9EQS3 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MycbpQ9EQS3 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MycbpQ9EQS3 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MycbpQ9EQS3 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MycbpQ9EQS3 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
MycbpQ9EQS3 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MycbpQ9EQS3 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MycbpQ9EQS3 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MycbpQ9EQS3 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MycbpQ9EQS3 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MycbpQ9EQS3 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MycbpQ9EQS3 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MycbpQ9EQS3 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MycbpQ9EQS3 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MycbpQ9EQS3 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MycbpQ9EQS3 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MycbpQ9EQS3 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MycbpQ9EQS3 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MycbpQ9EQS3 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MycbpQ9EQS3 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MycbpQ9EQS3 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MycbpQ9EQS3 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MycbpQ9EQS3 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MycbpQ9EQS3 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MycbpQ9EQS3 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MycbpQ9EQS3 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MycbpQ9EQS3 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
MycbpQ9EQS3 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
MycbpQ9EQS3 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MycbpQ9EQS3 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MycbpQ9EQS3 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MycbpQ9EQS3 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MycbpQ9EQS3 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MycbpQ9EQS3 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MycbpQ9EQS3 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MycbpQ9EQS3 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
MycbpQ9EQS3 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
MycbpQ9EQS3 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MycbpQ9EQS3 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MycbpQ9EQS3 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MycbpQ9EQS3 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MycbpQ9EQS3 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MycbpQ9EQS3 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MycbpQ9EQS3 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MycbpQ9EQS3 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MycbpQ9EQS3 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MycbpQ9EQS3 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MycbpQ9EQS3 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MycbpQ9EQS3 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MycbpQ9EQS3 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MycbpQ9EQS3 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms