Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQM5

Rhox9, Homeobox protein GPBOX, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox9Q9EQM5 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rhox9Q9EQM5 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rhox9Q9EQM5 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rhox9Q9EQM5 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rhox9Q9EQM5 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rhox9Q9EQM5 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rhox9Q9EQM5 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rhox9Q9EQM5 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Rhox9Q9EQM5 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rhox9Q9EQM5 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rhox9Q9EQM5 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rhox9Q9EQM5 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rhox9Q9EQM5 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rhox9Q9EQM5 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rhox9Q9EQM5 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rhox9Q9EQM5 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rhox9Q9EQM5 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rhox9Q9EQM5 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rhox9Q9EQM5 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rhox9Q9EQM5 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rhox9Q9EQM5 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rhox9Q9EQM5 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rhox9Q9EQM5 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rhox9Q9EQM5 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rhox9Q9EQM5 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rhox9Q9EQM5 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rhox9Q9EQM5 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rhox9Q9EQM5 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rhox9Q9EQM5 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rhox9Q9EQM5 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rhox9Q9EQM5 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rhox9Q9EQM5 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rhox9Q9EQM5 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rhox9Q9EQM5 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rhox9Q9EQM5 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rhox9Q9EQM5 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rhox9Q9EQM5 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
Rhox9Q9EQM5 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rhox9Q9EQM5 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rhox9Q9EQM5 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rhox9Q9EQM5 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rhox9Q9EQM5 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rhox9Q9EQM5 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rhox9Q9EQM5 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rhox9Q9EQM5 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rhox9Q9EQM5 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rhox9Q9EQM5 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rhox9Q9EQM5 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rhox9Q9EQM5 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rhox9Q9EQM5 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rhox9Q9EQM5 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rhox9Q9EQM5 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rhox9Q9EQM5 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rhox9Q9EQM5 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rhox9Q9EQM5 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Rhox9Q9EQM5 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Rhox9Q9EQM5 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rhox9Q9EQM5 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rhox9Q9EQM5 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rhox9Q9EQM5 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Rhox9Q9EQM5 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rhox9Q9EQM5 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rhox9Q9EQM5 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rhox9Q9EQM5 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rhox9Q9EQM5 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rhox9Q9EQM5 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rhox9Q9EQM5 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rhox9Q9EQM5 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rhox9Q9EQM5 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rhox9Q9EQM5 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Rhox9Q9EQM5 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Rhox9Q9EQM5 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Rhox9Q9EQM5 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Rhox9Q9EQM5 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rhox9Q9EQM5 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rhox9Q9EQM5 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rhox9Q9EQM5 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rhox9Q9EQM5 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rhox9Q9EQM5 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rhox9Q9EQM5 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rhox9Q9EQM5 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rhox9Q9EQM5 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rhox9Q9EQM5 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rhox9Q9EQM5 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rhox9Q9EQM5 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rhox9Q9EQM5 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rhox9Q9EQM5 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rhox9Q9EQM5 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rhox9Q9EQM5 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rhox9Q9EQM5 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rhox9Q9EQM5 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rhox9Q9EQM5 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rhox9Q9EQM5 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rhox9Q9EQM5 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rhox9Q9EQM5 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rhox9Q9EQM5 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rhox9Q9EQM5 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rhox9Q9EQM5 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rhox9Q9EQM5 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rhox9Q9EQM5 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms