Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPK2

Rp2, Protein XRP2, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rp2Q9EPK2 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Rp2Q9EPK2 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Rp2Q9EPK2 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rp2Q9EPK2 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rp2Q9EPK2 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rp2Q9EPK2 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rp2Q9EPK2 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rp2Q9EPK2 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rp2Q9EPK2 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rp2Q9EPK2 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Rp2Q9EPK2 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rp2Q9EPK2 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rp2Q9EPK2 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rp2Q9EPK2 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rp2Q9EPK2 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rp2Q9EPK2 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rp2Q9EPK2 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rp2Q9EPK2 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rp2Q9EPK2 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rp2Q9EPK2 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rp2Q9EPK2 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rp2Q9EPK2 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rp2Q9EPK2 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rp2Q9EPK2 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rp2Q9EPK2 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Rp2Q9EPK2 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rp2Q9EPK2 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rp2Q9EPK2 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rp2Q9EPK2 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rp2Q9EPK2 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Rp2Q9EPK2 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rp2Q9EPK2 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rp2Q9EPK2 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rp2Q9EPK2 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rp2Q9EPK2 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rp2Q9EPK2 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Rp2Q9EPK2 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Rp2Q9EPK2 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rp2Q9EPK2 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rp2Q9EPK2 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rp2Q9EPK2 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rp2Q9EPK2 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rp2Q9EPK2 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rp2Q9EPK2 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rp2Q9EPK2 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rp2Q9EPK2 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rp2Q9EPK2 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Rp2Q9EPK2 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Rp2Q9EPK2 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rp2Q9EPK2 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Rp2Q9EPK2 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rp2Q9EPK2 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rp2Q9EPK2 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rp2Q9EPK2 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rp2Q9EPK2 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rp2Q9EPK2 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rp2Q9EPK2 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Rp2Q9EPK2 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rp2Q9EPK2 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rp2Q9EPK2 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rp2Q9EPK2 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rp2Q9EPK2 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rp2Q9EPK2 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rp2Q9EPK2 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rp2Q9EPK2 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rp2Q9EPK2 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rp2Q9EPK2 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rp2Q9EPK2 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rp2Q9EPK2 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rp2Q9EPK2 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Rp2Q9EPK2 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rp2Q9EPK2 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rp2Q9EPK2 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rp2Q9EPK2 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rp2Q9EPK2 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Rp2Q9EPK2 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rp2Q9EPK2 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rp2Q9EPK2 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Rp2Q9EPK2 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rp2Q9EPK2 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rp2Q9EPK2 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rp2Q9EPK2 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rp2Q9EPK2 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rp2Q9EPK2 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rp2Q9EPK2 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rp2Q9EPK2 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rp2Q9EPK2 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Rp2Q9EPK2 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rp2Q9EPK2 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rp2Q9EPK2 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rp2Q9EPK2 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rp2Q9EPK2 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rp2Q9EPK2 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rp2Q9EPK2 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rp2Q9EPK2 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rp2Q9EPK2 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rp2Q9EPK2 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rp2Q9EPK2 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rp2Q9EPK2 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rp2Q9EPK2 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.3 ms