Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPJ9

Arfgap1, ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfgap1Q9EPJ9 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Arfgap1Q9EPJ9 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Arfgap1Q9EPJ9 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Arfgap1Q9EPJ9 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Arfgap1Q9EPJ9 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Arfgap1Q9EPJ9 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Arfgap1Q9EPJ9 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Arfgap1Q9EPJ9 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Arfgap1Q9EPJ9 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Arfgap1Q9EPJ9 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Arfgap1Q9EPJ9 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Arfgap1Q9EPJ9 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Arfgap1Q9EPJ9 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Arfgap1Q9EPJ9 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Arfgap1Q9EPJ9 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Arfgap1Q9EPJ9 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Arfgap1Q9EPJ9 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Arfgap1Q9EPJ9 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Arfgap1Q9EPJ9 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Arfgap1Q9EPJ9 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Arfgap1Q9EPJ9 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Arfgap1Q9EPJ9 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Arfgap1Q9EPJ9 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Arfgap1Q9EPJ9 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Arfgap1Q9EPJ9 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Arfgap1Q9EPJ9 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Arfgap1Q9EPJ9 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Arfgap1Q9EPJ9 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Arfgap1Q9EPJ9 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Arfgap1Q9EPJ9 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Arfgap1Q9EPJ9 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Arfgap1Q9EPJ9 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Arfgap1Q9EPJ9 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Arfgap1Q9EPJ9 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Arfgap1Q9EPJ9 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Arfgap1Q9EPJ9 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Arfgap1Q9EPJ9 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Arfgap1Q9EPJ9 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Arfgap1Q9EPJ9 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Arfgap1Q9EPJ9 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Arfgap1Q9EPJ9 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Arfgap1Q9EPJ9 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Arfgap1Q9EPJ9 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Arfgap1Q9EPJ9 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Arfgap1Q9EPJ9 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Arfgap1Q9EPJ9 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Arfgap1Q9EPJ9 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Arfgap1Q9EPJ9 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Arfgap1Q9EPJ9 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Arfgap1Q9EPJ9 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Arfgap1Q9EPJ9 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Arfgap1Q9EPJ9 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Arfgap1Q9EPJ9 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Arfgap1Q9EPJ9 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Arfgap1Q9EPJ9 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Arfgap1Q9EPJ9 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Arfgap1Q9EPJ9 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Arfgap1Q9EPJ9 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Arfgap1Q9EPJ9 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Arfgap1Q9EPJ9 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Arfgap1Q9EPJ9 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Arfgap1Q9EPJ9 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Arfgap1Q9EPJ9 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Arfgap1Q9EPJ9 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Arfgap1Q9EPJ9 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Arfgap1Q9EPJ9 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Arfgap1Q9EPJ9 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Arfgap1Q9EPJ9 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Arfgap1Q9EPJ9 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Arfgap1Q9EPJ9 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Arfgap1Q9EPJ9 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Arfgap1Q9EPJ9 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Arfgap1Q9EPJ9 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Arfgap1Q9EPJ9 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
Arfgap1Q9EPJ9 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Arfgap1Q9EPJ9 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Arfgap1Q9EPJ9 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Arfgap1Q9EPJ9 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Arfgap1Q9EPJ9 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Arfgap1Q9EPJ9 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Arfgap1Q9EPJ9 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Arfgap1Q9EPJ9 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Arfgap1Q9EPJ9 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Arfgap1Q9EPJ9 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Arfgap1Q9EPJ9 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Arfgap1Q9EPJ9 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Arfgap1Q9EPJ9 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Arfgap1Q9EPJ9 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Arfgap1Q9EPJ9 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Arfgap1Q9EPJ9 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Arfgap1Q9EPJ9 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Arfgap1Q9EPJ9 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Arfgap1Q9EPJ9 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Arfgap1Q9EPJ9 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Arfgap1Q9EPJ9 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Arfgap1Q9EPJ9 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Arfgap1Q9EPJ9 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Arfgap1Q9EPJ9 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Arfgap1Q9EPJ9 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Arfgap1Q9EPJ9 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.4 ms