Protein–RNA interactions for Protein: Q9EP82

Wdr4, tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase non-catalytic subunit WDR4, mousemouse

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr4Q9EP82 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Wdr4Q9EP82 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Wdr4Q9EP82 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Wdr4Q9EP82 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Wdr4Q9EP82 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Wdr4Q9EP82 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Wdr4Q9EP82 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Wdr4Q9EP82 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Wdr4Q9EP82 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Wdr4Q9EP82 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Wdr4Q9EP82 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Wdr4Q9EP82 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Wdr4Q9EP82 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Wdr4Q9EP82 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Wdr4Q9EP82 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Wdr4Q9EP82 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Wdr4Q9EP82 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Wdr4Q9EP82 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Wdr4Q9EP82 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Wdr4Q9EP82 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Wdr4Q9EP82 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Wdr4Q9EP82 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Wdr4Q9EP82 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Wdr4Q9EP82 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Wdr4Q9EP82 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Wdr4Q9EP82 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Wdr4Q9EP82 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Wdr4Q9EP82 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Wdr4Q9EP82 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Wdr4Q9EP82 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Wdr4Q9EP82 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Wdr4Q9EP82 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Wdr4Q9EP82 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Wdr4Q9EP82 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Wdr4Q9EP82 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Wdr4Q9EP82 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Wdr4Q9EP82 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Wdr4Q9EP82 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Wdr4Q9EP82 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Wdr4Q9EP82 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Wdr4Q9EP82 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Wdr4Q9EP82 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Wdr4Q9EP82 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Wdr4Q9EP82 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Wdr4Q9EP82 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Wdr4Q9EP82 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Wdr4Q9EP82 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Wdr4Q9EP82 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Wdr4Q9EP82 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Wdr4Q9EP82 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Wdr4Q9EP82 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Wdr4Q9EP82 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Wdr4Q9EP82 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Wdr4Q9EP82 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Wdr4Q9EP82 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Wdr4Q9EP82 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Wdr4Q9EP82 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Wdr4Q9EP82 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Wdr4Q9EP82 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Wdr4Q9EP82 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Wdr4Q9EP82 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Wdr4Q9EP82 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Wdr4Q9EP82 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Wdr4Q9EP82 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Wdr4Q9EP82 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Wdr4Q9EP82 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Wdr4Q9EP82 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Wdr4Q9EP82 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Wdr4Q9EP82 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Wdr4Q9EP82 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Wdr4Q9EP82 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Wdr4Q9EP82 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Wdr4Q9EP82 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Wdr4Q9EP82 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Wdr4Q9EP82 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Wdr4Q9EP82 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Wdr4Q9EP82 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Wdr4Q9EP82 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Wdr4Q9EP82 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Wdr4Q9EP82 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Wdr4Q9EP82 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Wdr4Q9EP82 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Wdr4Q9EP82 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Wdr4Q9EP82 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Wdr4Q9EP82 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Wdr4Q9EP82 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Wdr4Q9EP82 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Wdr4Q9EP82 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Wdr4Q9EP82 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Wdr4Q9EP82 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Wdr4Q9EP82 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Wdr4Q9EP82 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Wdr4Q9EP82 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Wdr4Q9EP82 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Wdr4Q9EP82 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Wdr4Q9EP82 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Wdr4Q9EP82 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Wdr4Q9EP82 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Wdr4Q9EP82 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Wdr4Q9EP82 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms