Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC33

Hmg20a, High mobility group protein 20A, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmg20aQ9DC33 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Hmg20aQ9DC33 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Hmg20aQ9DC33 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Hmg20aQ9DC33 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Hmg20aQ9DC33 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hmg20aQ9DC33 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hmg20aQ9DC33 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hmg20aQ9DC33 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Hmg20aQ9DC33 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hmg20aQ9DC33 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hmg20aQ9DC33 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hmg20aQ9DC33 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Hmg20aQ9DC33 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Hmg20aQ9DC33 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Hmg20aQ9DC33 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Hmg20aQ9DC33 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Hmg20aQ9DC33 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Hmg20aQ9DC33 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Hmg20aQ9DC33 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
Hmg20aQ9DC33 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Hmg20aQ9DC33 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Hmg20aQ9DC33 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Hmg20aQ9DC33 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hmg20aQ9DC33 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hmg20aQ9DC33 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hmg20aQ9DC33 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hmg20aQ9DC33 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hmg20aQ9DC33 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hmg20aQ9DC33 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Hmg20aQ9DC33 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hmg20aQ9DC33 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hmg20aQ9DC33 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hmg20aQ9DC33 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hmg20aQ9DC33 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hmg20aQ9DC33 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hmg20aQ9DC33 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hmg20aQ9DC33 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Hmg20aQ9DC33 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hmg20aQ9DC33 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hmg20aQ9DC33 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hmg20aQ9DC33 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hmg20aQ9DC33 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hmg20aQ9DC33 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hmg20aQ9DC33 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hmg20aQ9DC33 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hmg20aQ9DC33 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Hmg20aQ9DC33 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hmg20aQ9DC33 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hmg20aQ9DC33 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hmg20aQ9DC33 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hmg20aQ9DC33 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Hmg20aQ9DC33 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hmg20aQ9DC33 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hmg20aQ9DC33 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hmg20aQ9DC33 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hmg20aQ9DC33 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hmg20aQ9DC33 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hmg20aQ9DC33 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hmg20aQ9DC33 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hmg20aQ9DC33 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hmg20aQ9DC33 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Hmg20aQ9DC33 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Hmg20aQ9DC33 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Hmg20aQ9DC33 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Hmg20aQ9DC33 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Hmg20aQ9DC33 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Hmg20aQ9DC33 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hmg20aQ9DC33 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hmg20aQ9DC33 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hmg20aQ9DC33 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hmg20aQ9DC33 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hmg20aQ9DC33 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hmg20aQ9DC33 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Hmg20aQ9DC33 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Hmg20aQ9DC33 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Hmg20aQ9DC33 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Hmg20aQ9DC33 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Hmg20aQ9DC33 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Hmg20aQ9DC33 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Hmg20aQ9DC33 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hmg20aQ9DC33 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hmg20aQ9DC33 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hmg20aQ9DC33 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hmg20aQ9DC33 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Hmg20aQ9DC33 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Hmg20aQ9DC33 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Hmg20aQ9DC33 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Hmg20aQ9DC33 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hmg20aQ9DC33 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hmg20aQ9DC33 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hmg20aQ9DC33 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hmg20aQ9DC33 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hmg20aQ9DC33 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hmg20aQ9DC33 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hmg20aQ9DC33 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hmg20aQ9DC33 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hmg20aQ9DC33 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hmg20aQ9DC33 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Hmg20aQ9DC33 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Hmg20aQ9DC33 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms