Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAL0

Smim23, Small integral membrane protein 23, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim23Q9DAL0 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Smim23Q9DAL0 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Smim23Q9DAL0 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Smim23Q9DAL0 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Smim23Q9DAL0 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Smim23Q9DAL0 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Smim23Q9DAL0 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Smim23Q9DAL0 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Smim23Q9DAL0 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Smim23Q9DAL0 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Smim23Q9DAL0 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Smim23Q9DAL0 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Smim23Q9DAL0 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Smim23Q9DAL0 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Smim23Q9DAL0 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Smim23Q9DAL0 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Smim23Q9DAL0 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Smim23Q9DAL0 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Smim23Q9DAL0 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Smim23Q9DAL0 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Smim23Q9DAL0 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Smim23Q9DAL0 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Smim23Q9DAL0 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Smim23Q9DAL0 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Smim23Q9DAL0 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Smim23Q9DAL0 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Smim23Q9DAL0 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Smim23Q9DAL0 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Smim23Q9DAL0 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Smim23Q9DAL0 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Smim23Q9DAL0 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Smim23Q9DAL0 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Smim23Q9DAL0 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Smim23Q9DAL0 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Smim23Q9DAL0 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Smim23Q9DAL0 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Smim23Q9DAL0 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Smim23Q9DAL0 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Smim23Q9DAL0 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Smim23Q9DAL0 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Smim23Q9DAL0 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Smim23Q9DAL0 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Smim23Q9DAL0 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Smim23Q9DAL0 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Smim23Q9DAL0 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Smim23Q9DAL0 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Smim23Q9DAL0 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Smim23Q9DAL0 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Smim23Q9DAL0 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Smim23Q9DAL0 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Smim23Q9DAL0 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Smim23Q9DAL0 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Smim23Q9DAL0 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Smim23Q9DAL0 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Smim23Q9DAL0 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Smim23Q9DAL0 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Smim23Q9DAL0 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Smim23Q9DAL0 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Smim23Q9DAL0 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Smim23Q9DAL0 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Smim23Q9DAL0 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Smim23Q9DAL0 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Smim23Q9DAL0 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Smim23Q9DAL0 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Smim23Q9DAL0 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Smim23Q9DAL0 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Smim23Q9DAL0 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Smim23Q9DAL0 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Smim23Q9DAL0 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Smim23Q9DAL0 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Smim23Q9DAL0 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Smim23Q9DAL0 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Smim23Q9DAL0 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Smim23Q9DAL0 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Smim23Q9DAL0 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Smim23Q9DAL0 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Smim23Q9DAL0 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Smim23Q9DAL0 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Smim23Q9DAL0 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Smim23Q9DAL0 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Smim23Q9DAL0 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Smim23Q9DAL0 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Smim23Q9DAL0 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Smim23Q9DAL0 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Smim23Q9DAL0 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Smim23Q9DAL0 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Smim23Q9DAL0 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Smim23Q9DAL0 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Smim23Q9DAL0 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Smim23Q9DAL0 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Smim23Q9DAL0 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Smim23Q9DAL0 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Smim23Q9DAL0 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Smim23Q9DAL0 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Smim23Q9DAL0 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Smim23Q9DAL0 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Smim23Q9DAL0 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Smim23Q9DAL0 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Smim23Q9DAL0 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Smim23Q9DAL0 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms