Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAC6

1700013G24Rik, RIKEN cDNA 1700013G24 gene, mousemouse

Predictions only

Length 286 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700013G24RikQ9DAC6 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
1700013G24RikQ9DAC6 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
1700013G24RikQ9DAC6 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
1700013G24RikQ9DAC6 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
1700013G24RikQ9DAC6 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
1700013G24RikQ9DAC6 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
1700013G24RikQ9DAC6 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
1700013G24RikQ9DAC6 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
1700013G24RikQ9DAC6 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
1700013G24RikQ9DAC6 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
1700013G24RikQ9DAC6 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
1700013G24RikQ9DAC6 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
1700013G24RikQ9DAC6 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
1700013G24RikQ9DAC6 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
1700013G24RikQ9DAC6 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
1700013G24RikQ9DAC6 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
1700013G24RikQ9DAC6 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
1700013G24RikQ9DAC6 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
1700013G24RikQ9DAC6 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
1700013G24RikQ9DAC6 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
1700013G24RikQ9DAC6 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
1700013G24RikQ9DAC6 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
1700013G24RikQ9DAC6 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
1700013G24RikQ9DAC6 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
1700013G24RikQ9DAC6 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
1700013G24RikQ9DAC6 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
1700013G24RikQ9DAC6 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
1700013G24RikQ9DAC6 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
1700013G24RikQ9DAC6 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
1700013G24RikQ9DAC6 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
1700013G24RikQ9DAC6 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
1700013G24RikQ9DAC6 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
1700013G24RikQ9DAC6 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
1700013G24RikQ9DAC6 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
1700013G24RikQ9DAC6 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
1700013G24RikQ9DAC6 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
1700013G24RikQ9DAC6 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
1700013G24RikQ9DAC6 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
1700013G24RikQ9DAC6 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
1700013G24RikQ9DAC6 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
1700013G24RikQ9DAC6 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
1700013G24RikQ9DAC6 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
1700013G24RikQ9DAC6 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
1700013G24RikQ9DAC6 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
1700013G24RikQ9DAC6 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
1700013G24RikQ9DAC6 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
1700013G24RikQ9DAC6 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
1700013G24RikQ9DAC6 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
1700013G24RikQ9DAC6 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
1700013G24RikQ9DAC6 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
1700013G24RikQ9DAC6 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
1700013G24RikQ9DAC6 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
1700013G24RikQ9DAC6 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
1700013G24RikQ9DAC6 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
1700013G24RikQ9DAC6 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
1700013G24RikQ9DAC6 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
1700013G24RikQ9DAC6 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
1700013G24RikQ9DAC6 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
1700013G24RikQ9DAC6 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
1700013G24RikQ9DAC6 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
1700013G24RikQ9DAC6 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
1700013G24RikQ9DAC6 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
1700013G24RikQ9DAC6 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
1700013G24RikQ9DAC6 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
1700013G24RikQ9DAC6 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
1700013G24RikQ9DAC6 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
1700013G24RikQ9DAC6 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
1700013G24RikQ9DAC6 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
1700013G24RikQ9DAC6 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
1700013G24RikQ9DAC6 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
1700013G24RikQ9DAC6 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
1700013G24RikQ9DAC6 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
1700013G24RikQ9DAC6 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
1700013G24RikQ9DAC6 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
1700013G24RikQ9DAC6 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
1700013G24RikQ9DAC6 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
1700013G24RikQ9DAC6 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
1700013G24RikQ9DAC6 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
1700013G24RikQ9DAC6 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
1700013G24RikQ9DAC6 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
1700013G24RikQ9DAC6 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
1700013G24RikQ9DAC6 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
1700013G24RikQ9DAC6 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
1700013G24RikQ9DAC6 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
1700013G24RikQ9DAC6 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
1700013G24RikQ9DAC6 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
1700013G24RikQ9DAC6 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
1700013G24RikQ9DAC6 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
1700013G24RikQ9DAC6 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
1700013G24RikQ9DAC6 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
1700013G24RikQ9DAC6 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
1700013G24RikQ9DAC6 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
1700013G24RikQ9DAC6 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
1700013G24RikQ9DAC6 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
1700013G24RikQ9DAC6 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
1700013G24RikQ9DAC6 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
1700013G24RikQ9DAC6 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
1700013G24RikQ9DAC6 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
1700013G24RikQ9DAC6 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
1700013G24RikQ9DAC6 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.8 ms