Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9H3

Mbd3l1, Methyl-CpG-binding domain protein 3-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd3l1Q9D9H3 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Mbd3l1Q9D9H3 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Mbd3l1Q9D9H3 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Mbd3l1Q9D9H3 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Mbd3l1Q9D9H3 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Mbd3l1Q9D9H3 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Mbd3l1Q9D9H3 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Mbd3l1Q9D9H3 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Mbd3l1Q9D9H3 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Mbd3l1Q9D9H3 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Mbd3l1Q9D9H3 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Mbd3l1Q9D9H3 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Mbd3l1Q9D9H3 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Mbd3l1Q9D9H3 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Mbd3l1Q9D9H3 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Mbd3l1Q9D9H3 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Mbd3l1Q9D9H3 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Mbd3l1Q9D9H3 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Mbd3l1Q9D9H3 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Mbd3l1Q9D9H3 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Mbd3l1Q9D9H3 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Mbd3l1Q9D9H3 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Mbd3l1Q9D9H3 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Mbd3l1Q9D9H3 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Mbd3l1Q9D9H3 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Mbd3l1Q9D9H3 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Mbd3l1Q9D9H3 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Mbd3l1Q9D9H3 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Mbd3l1Q9D9H3 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Mbd3l1Q9D9H3 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Mbd3l1Q9D9H3 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Mbd3l1Q9D9H3 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Mbd3l1Q9D9H3 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Mbd3l1Q9D9H3 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Mbd3l1Q9D9H3 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Mbd3l1Q9D9H3 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Mbd3l1Q9D9H3 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Mbd3l1Q9D9H3 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Mbd3l1Q9D9H3 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Mbd3l1Q9D9H3 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Mbd3l1Q9D9H3 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Mbd3l1Q9D9H3 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Mbd3l1Q9D9H3 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Mbd3l1Q9D9H3 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Mbd3l1Q9D9H3 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Mbd3l1Q9D9H3 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Mbd3l1Q9D9H3 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mbd3l1Q9D9H3 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mbd3l1Q9D9H3 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mbd3l1Q9D9H3 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mbd3l1Q9D9H3 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mbd3l1Q9D9H3 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Mbd3l1Q9D9H3 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Mbd3l1Q9D9H3 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Mbd3l1Q9D9H3 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Mbd3l1Q9D9H3 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Mbd3l1Q9D9H3 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Mbd3l1Q9D9H3 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Mbd3l1Q9D9H3 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Mbd3l1Q9D9H3 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mbd3l1Q9D9H3 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mbd3l1Q9D9H3 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Mbd3l1Q9D9H3 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Mbd3l1Q9D9H3 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Mbd3l1Q9D9H3 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Mbd3l1Q9D9H3 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Mbd3l1Q9D9H3 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mbd3l1Q9D9H3 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mbd3l1Q9D9H3 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Mbd3l1Q9D9H3 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mbd3l1Q9D9H3 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mbd3l1Q9D9H3 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mbd3l1Q9D9H3 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mbd3l1Q9D9H3 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mbd3l1Q9D9H3 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Mbd3l1Q9D9H3 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Mbd3l1Q9D9H3 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Mbd3l1Q9D9H3 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Mbd3l1Q9D9H3 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Mbd3l1Q9D9H3 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Mbd3l1Q9D9H3 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Mbd3l1Q9D9H3 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Mbd3l1Q9D9H3 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Mbd3l1Q9D9H3 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Mbd3l1Q9D9H3 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Mbd3l1Q9D9H3 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Mbd3l1Q9D9H3 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Mbd3l1Q9D9H3 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Mbd3l1Q9D9H3 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Mbd3l1Q9D9H3 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Mbd3l1Q9D9H3 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Mbd3l1Q9D9H3 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Mbd3l1Q9D9H3 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Mbd3l1Q9D9H3 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Mbd3l1Q9D9H3 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Mbd3l1Q9D9H3 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Mbd3l1Q9D9H3 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Mbd3l1Q9D9H3 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Mbd3l1Q9D9H3 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Mbd3l1Q9D9H3 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms