Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9G4

1700080O16Rik, 1700080O16Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700080O16RikQ9D9G4 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
1700080O16RikQ9D9G4 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
1700080O16RikQ9D9G4 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
1700080O16RikQ9D9G4 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
1700080O16RikQ9D9G4 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
1700080O16RikQ9D9G4 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
1700080O16RikQ9D9G4 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
1700080O16RikQ9D9G4 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
1700080O16RikQ9D9G4 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
1700080O16RikQ9D9G4 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
1700080O16RikQ9D9G4 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
1700080O16RikQ9D9G4 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
1700080O16RikQ9D9G4 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
1700080O16RikQ9D9G4 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
1700080O16RikQ9D9G4 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
1700080O16RikQ9D9G4 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
1700080O16RikQ9D9G4 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
1700080O16RikQ9D9G4 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
1700080O16RikQ9D9G4 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
1700080O16RikQ9D9G4 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
1700080O16RikQ9D9G4 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
1700080O16RikQ9D9G4 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
1700080O16RikQ9D9G4 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
1700080O16RikQ9D9G4 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
1700080O16RikQ9D9G4 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
1700080O16RikQ9D9G4 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
1700080O16RikQ9D9G4 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
1700080O16RikQ9D9G4 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
1700080O16RikQ9D9G4 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
1700080O16RikQ9D9G4 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
1700080O16RikQ9D9G4 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
1700080O16RikQ9D9G4 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
1700080O16RikQ9D9G4 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
1700080O16RikQ9D9G4 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
1700080O16RikQ9D9G4 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
1700080O16RikQ9D9G4 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
1700080O16RikQ9D9G4 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
1700080O16RikQ9D9G4 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
1700080O16RikQ9D9G4 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
1700080O16RikQ9D9G4 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
1700080O16RikQ9D9G4 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
1700080O16RikQ9D9G4 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
1700080O16RikQ9D9G4 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
1700080O16RikQ9D9G4 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
1700080O16RikQ9D9G4 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
1700080O16RikQ9D9G4 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
1700080O16RikQ9D9G4 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
1700080O16RikQ9D9G4 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
1700080O16RikQ9D9G4 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
1700080O16RikQ9D9G4 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
1700080O16RikQ9D9G4 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
1700080O16RikQ9D9G4 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
1700080O16RikQ9D9G4 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
1700080O16RikQ9D9G4 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
1700080O16RikQ9D9G4 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
1700080O16RikQ9D9G4 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
1700080O16RikQ9D9G4 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
1700080O16RikQ9D9G4 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
1700080O16RikQ9D9G4 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
1700080O16RikQ9D9G4 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
1700080O16RikQ9D9G4 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
1700080O16RikQ9D9G4 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
1700080O16RikQ9D9G4 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
1700080O16RikQ9D9G4 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
1700080O16RikQ9D9G4 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
1700080O16RikQ9D9G4 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
1700080O16RikQ9D9G4 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
1700080O16RikQ9D9G4 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
1700080O16RikQ9D9G4 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
1700080O16RikQ9D9G4 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
1700080O16RikQ9D9G4 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
1700080O16RikQ9D9G4 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
1700080O16RikQ9D9G4 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
1700080O16RikQ9D9G4 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
1700080O16RikQ9D9G4 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
1700080O16RikQ9D9G4 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
1700080O16RikQ9D9G4 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
1700080O16RikQ9D9G4 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
1700080O16RikQ9D9G4 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
1700080O16RikQ9D9G4 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
1700080O16RikQ9D9G4 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
1700080O16RikQ9D9G4 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
1700080O16RikQ9D9G4 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
1700080O16RikQ9D9G4 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
1700080O16RikQ9D9G4 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
1700080O16RikQ9D9G4 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
1700080O16RikQ9D9G4 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
1700080O16RikQ9D9G4 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
1700080O16RikQ9D9G4 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
1700080O16RikQ9D9G4 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
1700080O16RikQ9D9G4 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
1700080O16RikQ9D9G4 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
1700080O16RikQ9D9G4 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
1700080O16RikQ9D9G4 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
1700080O16RikQ9D9G4 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
1700080O16RikQ9D9G4 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
1700080O16RikQ9D9G4 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
1700080O16RikQ9D9G4 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
1700080O16RikQ9D9G4 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
1700080O16RikQ9D9G4 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms