Protein–RNA interactions for Protein: Q9D920

Borcs5, BLOC-1-related complex subunit 5, mousemouse

Predictions only

Length 195 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Borcs5Q9D920 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Borcs5Q9D920 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Borcs5Q9D920 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Borcs5Q9D920 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Borcs5Q9D920 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Borcs5Q9D920 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Borcs5Q9D920 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Borcs5Q9D920 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Borcs5Q9D920 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Borcs5Q9D920 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Borcs5Q9D920 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Borcs5Q9D920 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Borcs5Q9D920 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Borcs5Q9D920 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Borcs5Q9D920 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Borcs5Q9D920 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Borcs5Q9D920 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Borcs5Q9D920 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Borcs5Q9D920 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Borcs5Q9D920 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Borcs5Q9D920 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Borcs5Q9D920 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Borcs5Q9D920 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Borcs5Q9D920 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Borcs5Q9D920 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Borcs5Q9D920 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Borcs5Q9D920 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Borcs5Q9D920 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Borcs5Q9D920 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Borcs5Q9D920 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Borcs5Q9D920 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
Borcs5Q9D920 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Borcs5Q9D920 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Borcs5Q9D920 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Borcs5Q9D920 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Borcs5Q9D920 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Borcs5Q9D920 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Borcs5Q9D920 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Borcs5Q9D920 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Borcs5Q9D920 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Borcs5Q9D920 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Borcs5Q9D920 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Borcs5Q9D920 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Borcs5Q9D920 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Borcs5Q9D920 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Borcs5Q9D920 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Borcs5Q9D920 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Borcs5Q9D920 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Borcs5Q9D920 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Borcs5Q9D920 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Borcs5Q9D920 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Borcs5Q9D920 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Borcs5Q9D920 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Borcs5Q9D920 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Borcs5Q9D920 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Borcs5Q9D920 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Borcs5Q9D920 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Borcs5Q9D920 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Borcs5Q9D920 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Borcs5Q9D920 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Borcs5Q9D920 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Borcs5Q9D920 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Borcs5Q9D920 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Borcs5Q9D920 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Borcs5Q9D920 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Borcs5Q9D920 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Borcs5Q9D920 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Borcs5Q9D920 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Borcs5Q9D920 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Borcs5Q9D920 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Borcs5Q9D920 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Borcs5Q9D920 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Borcs5Q9D920 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Borcs5Q9D920 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Borcs5Q9D920 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Borcs5Q9D920 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Borcs5Q9D920 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Borcs5Q9D920 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Borcs5Q9D920 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Borcs5Q9D920 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Borcs5Q9D920 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Borcs5Q9D920 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Borcs5Q9D920 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Borcs5Q9D920 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Borcs5Q9D920 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Borcs5Q9D920 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Borcs5Q9D920 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Borcs5Q9D920 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Borcs5Q9D920 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Borcs5Q9D920 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Borcs5Q9D920 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Borcs5Q9D920 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Borcs5Q9D920 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Borcs5Q9D920 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Borcs5Q9D920 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Borcs5Q9D920 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Borcs5Q9D920 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Borcs5Q9D920 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Borcs5Q9D920 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Borcs5Q9D920 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms