Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8T7

Slirp, SRA stem-loop-interacting RNA-binding protein, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 112 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SlirpQ9D8T7 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SlirpQ9D8T7 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SlirpQ9D8T7 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SlirpQ9D8T7 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SlirpQ9D8T7 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SlirpQ9D8T7 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SlirpQ9D8T7 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SlirpQ9D8T7 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SlirpQ9D8T7 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SlirpQ9D8T7 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SlirpQ9D8T7 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SlirpQ9D8T7 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SlirpQ9D8T7 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SlirpQ9D8T7 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SlirpQ9D8T7 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SlirpQ9D8T7 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SlirpQ9D8T7 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SlirpQ9D8T7 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SlirpQ9D8T7 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SlirpQ9D8T7 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SlirpQ9D8T7 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SlirpQ9D8T7 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SlirpQ9D8T7 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SlirpQ9D8T7 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SlirpQ9D8T7 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SlirpQ9D8T7 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SlirpQ9D8T7 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SlirpQ9D8T7 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SlirpQ9D8T7 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SlirpQ9D8T7 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SlirpQ9D8T7 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SlirpQ9D8T7 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SlirpQ9D8T7 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SlirpQ9D8T7 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SlirpQ9D8T7 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SlirpQ9D8T7 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SlirpQ9D8T7 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SlirpQ9D8T7 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SlirpQ9D8T7 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SlirpQ9D8T7 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SlirpQ9D8T7 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SlirpQ9D8T7 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SlirpQ9D8T7 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SlirpQ9D8T7 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SlirpQ9D8T7 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SlirpQ9D8T7 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SlirpQ9D8T7 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SlirpQ9D8T7 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SlirpQ9D8T7 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SlirpQ9D8T7 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SlirpQ9D8T7 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SlirpQ9D8T7 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SlirpQ9D8T7 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SlirpQ9D8T7 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SlirpQ9D8T7 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SlirpQ9D8T7 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SlirpQ9D8T7 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SlirpQ9D8T7 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SlirpQ9D8T7 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SlirpQ9D8T7 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SlirpQ9D8T7 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SlirpQ9D8T7 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SlirpQ9D8T7 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SlirpQ9D8T7 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SlirpQ9D8T7 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SlirpQ9D8T7 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SlirpQ9D8T7 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SlirpQ9D8T7 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SlirpQ9D8T7 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SlirpQ9D8T7 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SlirpQ9D8T7 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SlirpQ9D8T7 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SlirpQ9D8T7 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SlirpQ9D8T7 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SlirpQ9D8T7 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SlirpQ9D8T7 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SlirpQ9D8T7 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SlirpQ9D8T7 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SlirpQ9D8T7 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SlirpQ9D8T7 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SlirpQ9D8T7 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SlirpQ9D8T7 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SlirpQ9D8T7 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SlirpQ9D8T7 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SlirpQ9D8T7 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SlirpQ9D8T7 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SlirpQ9D8T7 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SlirpQ9D8T7 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SlirpQ9D8T7 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SlirpQ9D8T7 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SlirpQ9D8T7 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SlirpQ9D8T7 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SlirpQ9D8T7 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SlirpQ9D8T7 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SlirpQ9D8T7 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SlirpQ9D8T7 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SlirpQ9D8T7 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SlirpQ9D8T7 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SlirpQ9D8T7 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SlirpQ9D8T7 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms