Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8N1

Uncharacterized protein C11orf24 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D8N1 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Q9D8N1 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Q9D8N1 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Q9D8N1 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Q9D8N1 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Q9D8N1 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Q9D8N1 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Q9D8N1 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Q9D8N1 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Q9D8N1 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Q9D8N1 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Q9D8N1 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Q9D8N1 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Q9D8N1 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Q9D8N1 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Q9D8N1 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Q9D8N1 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Q9D8N1 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Q9D8N1 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Q9D8N1 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Q9D8N1 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Q9D8N1 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Q9D8N1 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Q9D8N1 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Q9D8N1 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Q9D8N1 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Q9D8N1 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Q9D8N1 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Q9D8N1 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Q9D8N1 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Q9D8N1 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Q9D8N1 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Q9D8N1 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Q9D8N1 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Q9D8N1 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Q9D8N1 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Q9D8N1 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Q9D8N1 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Q9D8N1 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Q9D8N1 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Q9D8N1 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Q9D8N1 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Q9D8N1 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Q9D8N1 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Q9D8N1 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Q9D8N1 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Q9D8N1 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Q9D8N1 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Q9D8N1 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Q9D8N1 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Q9D8N1 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Q9D8N1 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Q9D8N1 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Q9D8N1 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Q9D8N1 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Q9D8N1 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Q9D8N1 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Q9D8N1 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Q9D8N1 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Q9D8N1 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Q9D8N1 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Q9D8N1 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Q9D8N1 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Q9D8N1 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Q9D8N1 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Q9D8N1 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Q9D8N1 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Q9D8N1 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Q9D8N1 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Q9D8N1 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Q9D8N1 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Q9D8N1 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Q9D8N1 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Q9D8N1 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Q9D8N1 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Q9D8N1 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Q9D8N1 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Q9D8N1 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Q9D8N1 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Q9D8N1 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Q9D8N1 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Q9D8N1 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Q9D8N1 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Q9D8N1 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Q9D8N1 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Q9D8N1 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Q9D8N1 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Q9D8N1 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Q9D8N1 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Q9D8N1 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Q9D8N1 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Q9D8N1 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Q9D8N1 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Q9D8N1 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Q9D8N1 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Q9D8N1 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Q9D8N1 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Q9D8N1 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Q9D8N1 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Q9D8N1 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms