Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8C2

Tspan13, Tetraspanin-13, mousemouse

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Length 204 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan13Q9D8C2 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
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Tspan13Q9D8C2 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
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Tspan13Q9D8C2 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tspan13Q9D8C2 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tspan13Q9D8C2 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
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Tspan13Q9D8C2 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tspan13Q9D8C2 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tspan13Q9D8C2 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tspan13Q9D8C2 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tspan13Q9D8C2 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tspan13Q9D8C2 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tspan13Q9D8C2 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Tspan13Q9D8C2 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tspan13Q9D8C2 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Tspan13Q9D8C2 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tspan13Q9D8C2 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tspan13Q9D8C2 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tspan13Q9D8C2 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tspan13Q9D8C2 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Tspan13Q9D8C2 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tspan13Q9D8C2 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tspan13Q9D8C2 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tspan13Q9D8C2 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tspan13Q9D8C2 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
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