Protein–RNA interactions for Protein: Q9D824

Fip1l1, Pre-mRNA 3'-end-processing factor FIP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fip1l1Q9D824 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Fip1l1Q9D824 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Fip1l1Q9D824 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Fip1l1Q9D824 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Fip1l1Q9D824 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Fip1l1Q9D824 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Fip1l1Q9D824 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Fip1l1Q9D824 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Fip1l1Q9D824 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Fip1l1Q9D824 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Fip1l1Q9D824 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Fip1l1Q9D824 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Fip1l1Q9D824 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Fip1l1Q9D824 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Fip1l1Q9D824 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Fip1l1Q9D824 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Fip1l1Q9D824 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Fip1l1Q9D824 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Fip1l1Q9D824 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Fip1l1Q9D824 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Fip1l1Q9D824 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Fip1l1Q9D824 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Fip1l1Q9D824 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Fip1l1Q9D824 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Fip1l1Q9D824 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Fip1l1Q9D824 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Fip1l1Q9D824 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Fip1l1Q9D824 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Fip1l1Q9D824 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Fip1l1Q9D824 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Fip1l1Q9D824 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Fip1l1Q9D824 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Fip1l1Q9D824 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Fip1l1Q9D824 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Fip1l1Q9D824 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Fip1l1Q9D824 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Fip1l1Q9D824 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Fip1l1Q9D824 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Fip1l1Q9D824 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Fip1l1Q9D824 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Fip1l1Q9D824 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Fip1l1Q9D824 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Fip1l1Q9D824 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Fip1l1Q9D824 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Fip1l1Q9D824 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Fip1l1Q9D824 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Fip1l1Q9D824 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Fip1l1Q9D824 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Fip1l1Q9D824 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Fip1l1Q9D824 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Fip1l1Q9D824 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Fip1l1Q9D824 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Fip1l1Q9D824 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Fip1l1Q9D824 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Fip1l1Q9D824 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Fip1l1Q9D824 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Fip1l1Q9D824 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Fip1l1Q9D824 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Fip1l1Q9D824 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Fip1l1Q9D824 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Fip1l1Q9D824 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Fip1l1Q9D824 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Fip1l1Q9D824 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Fip1l1Q9D824 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Fip1l1Q9D824 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Fip1l1Q9D824 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Fip1l1Q9D824 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Fip1l1Q9D824 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Fip1l1Q9D824 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Fip1l1Q9D824 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Fip1l1Q9D824 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Fip1l1Q9D824 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Fip1l1Q9D824 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Fip1l1Q9D824 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Fip1l1Q9D824 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Fip1l1Q9D824 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Fip1l1Q9D824 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Fip1l1Q9D824 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Fip1l1Q9D824 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Fip1l1Q9D824 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Fip1l1Q9D824 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Fip1l1Q9D824 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Fip1l1Q9D824 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Fip1l1Q9D824 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Fip1l1Q9D824 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Fip1l1Q9D824 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Fip1l1Q9D824 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Fip1l1Q9D824 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Fip1l1Q9D824 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Fip1l1Q9D824 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Fip1l1Q9D824 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Fip1l1Q9D824 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Fip1l1Q9D824 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Fip1l1Q9D824 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Fip1l1Q9D824 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Fip1l1Q9D824 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Fip1l1Q9D824 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Fip1l1Q9D824 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Fip1l1Q9D824 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Fip1l1Q9D824 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.2 ms