Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7F7

Chmp4c, Charged multivesicular body protein 4c, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp4cQ9D7F7 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Chmp4cQ9D7F7 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Chmp4cQ9D7F7 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Chmp4cQ9D7F7 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Chmp4cQ9D7F7 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC30.9■■■□□ 2.54
Chmp4cQ9D7F7 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Chmp4cQ9D7F7 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
Chmp4cQ9D7F7 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Chmp4cQ9D7F7 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
Chmp4cQ9D7F7 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Chmp4cQ9D7F7 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC30.83■■■□□ 2.53
Chmp4cQ9D7F7 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Chmp4cQ9D7F7 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC30.82■■■□□ 2.52
Chmp4cQ9D7F7 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
Chmp4cQ9D7F7 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Chmp4cQ9D7F7 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Chmp4cQ9D7F7 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Chmp4cQ9D7F7 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
Chmp4cQ9D7F7 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Chmp4cQ9D7F7 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
Chmp4cQ9D7F7 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Chmp4cQ9D7F7 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
Chmp4cQ9D7F7 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
Chmp4cQ9D7F7 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC30.75■■■□□ 2.51
Chmp4cQ9D7F7 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Chmp4cQ9D7F7 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC30.71■■■□□ 2.51
Chmp4cQ9D7F7 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
Chmp4cQ9D7F7 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
Chmp4cQ9D7F7 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.69■■■□□ 2.5
Chmp4cQ9D7F7 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Chmp4cQ9D7F7 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Chmp4cQ9D7F7 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Chmp4cQ9D7F7 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Chmp4cQ9D7F7 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.5
Chmp4cQ9D7F7 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC30.62■■■□□ 2.49
Chmp4cQ9D7F7 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC30.62■■■□□ 2.49
Chmp4cQ9D7F7 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Chmp4cQ9D7F7 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Chmp4cQ9D7F7 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Chmp4cQ9D7F7 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Chmp4cQ9D7F7 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Chmp4cQ9D7F7 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC30.58■■■□□ 2.49
Chmp4cQ9D7F7 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Chmp4cQ9D7F7 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
Chmp4cQ9D7F7 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC30.56■■■□□ 2.48
Chmp4cQ9D7F7 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
Chmp4cQ9D7F7 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Chmp4cQ9D7F7 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Chmp4cQ9D7F7 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC30.48■■■□□ 2.47
Chmp4cQ9D7F7 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Chmp4cQ9D7F7 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC30.47■■■□□ 2.47
Chmp4cQ9D7F7 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Chmp4cQ9D7F7 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Chmp4cQ9D7F7 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Chmp4cQ9D7F7 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
Chmp4cQ9D7F7 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
Chmp4cQ9D7F7 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Chmp4cQ9D7F7 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Chmp4cQ9D7F7 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Chmp4cQ9D7F7 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Chmp4cQ9D7F7 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Chmp4cQ9D7F7 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Chmp4cQ9D7F7 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
Chmp4cQ9D7F7 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Chmp4cQ9D7F7 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.45
Chmp4cQ9D7F7 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC30.36■■■□□ 2.45
Chmp4cQ9D7F7 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Chmp4cQ9D7F7 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Chmp4cQ9D7F7 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Chmp4cQ9D7F7 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Chmp4cQ9D7F7 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Chmp4cQ9D7F7 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Chmp4cQ9D7F7 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Chmp4cQ9D7F7 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Chmp4cQ9D7F7 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Chmp4cQ9D7F7 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Chmp4cQ9D7F7 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
Chmp4cQ9D7F7 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Chmp4cQ9D7F7 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Chmp4cQ9D7F7 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.42
Chmp4cQ9D7F7 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
Chmp4cQ9D7F7 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
Chmp4cQ9D7F7 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.42
Chmp4cQ9D7F7 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Chmp4cQ9D7F7 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Chmp4cQ9D7F7 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Chmp4cQ9D7F7 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
Chmp4cQ9D7F7 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
Chmp4cQ9D7F7 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Chmp4cQ9D7F7 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Chmp4cQ9D7F7 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Chmp4cQ9D7F7 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Chmp4cQ9D7F7 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Chmp4cQ9D7F7 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
Chmp4cQ9D7F7 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Chmp4cQ9D7F7 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
Chmp4cQ9D7F7 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Chmp4cQ9D7F7 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Chmp4cQ9D7F7 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
Chmp4cQ9D7F7 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms