Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7E4

UPF0449 protein C19orf25 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D7E4 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Q9D7E4 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Q9D7E4 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Q9D7E4 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Q9D7E4 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Q9D7E4 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Q9D7E4 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Q9D7E4 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Q9D7E4 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Q9D7E4 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Q9D7E4 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Q9D7E4 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Q9D7E4 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Q9D7E4 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Q9D7E4 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Q9D7E4 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Q9D7E4 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Q9D7E4 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Q9D7E4 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Q9D7E4 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Q9D7E4 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Q9D7E4 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Q9D7E4 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Q9D7E4 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Q9D7E4 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Q9D7E4 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Q9D7E4 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Q9D7E4 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Q9D7E4 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Q9D7E4 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Q9D7E4 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Q9D7E4 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Q9D7E4 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Q9D7E4 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Q9D7E4 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Q9D7E4 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Q9D7E4 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Q9D7E4 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Q9D7E4 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Q9D7E4 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Q9D7E4 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Q9D7E4 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Q9D7E4 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Q9D7E4 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Q9D7E4 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Q9D7E4 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Q9D7E4 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Q9D7E4 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Q9D7E4 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Q9D7E4 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Q9D7E4 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Q9D7E4 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Q9D7E4 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Q9D7E4 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Q9D7E4 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Q9D7E4 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Q9D7E4 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Q9D7E4 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Q9D7E4 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Q9D7E4 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Q9D7E4 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Q9D7E4 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Q9D7E4 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Q9D7E4 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Q9D7E4 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Q9D7E4 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Q9D7E4 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Q9D7E4 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Q9D7E4 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Q9D7E4 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Q9D7E4 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Q9D7E4 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Q9D7E4 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Q9D7E4 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Q9D7E4 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Q9D7E4 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
Q9D7E4 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Q9D7E4 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Q9D7E4 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Q9D7E4 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Q9D7E4 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Q9D7E4 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Q9D7E4 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Q9D7E4 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Q9D7E4 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Q9D7E4 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Q9D7E4 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Q9D7E4 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Q9D7E4 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Q9D7E4 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Q9D7E4 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Q9D7E4 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Q9D7E4 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Q9D7E4 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Q9D7E4 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Q9D7E4 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Q9D7E4 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Q9D7E4 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Q9D7E4 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Q9D7E4 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms